Богомолец попал в весьма щекотливое положение. По сути дела, он оказался в чужой стране, не имея никакого правового статуса. Он даже готов был уехать в Алжир, который контролировался генералом де Голлем, но это не получилось. Богомолец еще дважды виделся с Гибсоном: когда тот ехал в Лондон и когда возвращался в Стамбул через Каир. На последней встрече Гибсон весьма невнятно пояснил Богомольцу, что наверху, мол, недовольны его опрометчивыми поступками в Португалии. Кроме крайнего недоумения, вызвать это у Богомольца ничего не могло, а его положение становилось все более неопределенным. Гибсон, сославшись на поручение, предложил ему выправить польский паспорт, но тот категорически отказался, настаивая на возвращении ему британского хотя бы для выезда в Париж. Волокита продолжалась. В конце концов в британском консульстве ему сказали, что Форин Оффис не может официально вернуть ему паспорт, ибо он не является британским подданным и не находится более на английской службе. Ему, правда, обещали посодействовать в получении разрешения на возвращение во Францию.
Отношение к нему англичан Богомолец, по его собственному выражению, определил как «гнусность и свинство».
Надо было как-то устраиваться, да и зарабатывать на жизнь тоже, ведь сбережения его семьи не так уж велики. Он знакомится с секретарем китайского посольства в Каире, который, по его наблюдениям, активно занимался сбором политической информации, вращаясь среди постояльцев отеля. Китайский представитель уже с первых бесед с Богомольцем оценил его осведомленность и аналитические способности и стал прибегать к его услугам, оплачивая их сравнительно небольшими суммами в египетских фунтах. Богомольца в его положении устраивала и такая работа.
Китайца, в частности, интересовали оценки внешней политики Кремля, и он даже попросил Богомольца подготовить специальное сообщение на эту тему. Богомолец неоднократно задавал себе вопрос, чем вызван этот интерес, казалось, Каир не самое удачное место для получения такого рода информации.
Собственные размышления привели его к выводу, что действия китайского дипломата имеют, возможно, свое объяснение. В Каире в конце ноября 1943 года состоялась конференция с участием президента Рузвельта, премьер-министра Черчилля и генералиссимуса Чан Кайши, на которой были обсуждены и политические вопросы, касавшиеся Китая. Были приняты решения о намерении участвующих в конференции сторон лишить Японию захваченных ею территорий в Тихом океане, а Маньчжурию и Формозу вернуть Китаю. На последовавшей затем встрече Сталина, Рузвельта и Черчилля в Тегеране, закончившейся 1 декабря, было договорено об открытии второго фронта, проведении операции «Оверлорд» и сроках вступления Советского Союза в войну с Японией. Поэтому вполне естественно, что китайскую дипломатию и разведку интересовало, не появилось ли каких-либо новых акцентов в политике союзников в отношении Китая, сохранились ли полностью каирские договоренности, не возникло ли каких-либо нюансов по комплексу вопросов послевоенного устройства в Азии.