Официально яхта была заказана в 1897 г. савойским принцем А. Видом, который «любезно обещал выделять ее для проведения зоологических экскурсий».
Яхту проектировал инженер К.П. Боклевский, в то время исполнявший во Франции обязанности «наблюдающего по кораблестроительной части», где строились броненосец «Цесаревич» и крейсер «Баян». Общий же контроль за постройкой всех русских кораблей, в том числе и яхты «Велелла», осуществлял капитан 2-го ранга И.К. Григорович, будущий морской министр. Уже одно это говорило о военном значении строившегося судна.
«Велелла» строилась в 1898—1899 гг. в Цюризе фирмой «Gescher-Wyss & С°». В начале 1900 г. яхта по железной дороге была перевезена в Геную, а затем на буксире парохода переведена в порт Санта-Маргарита. Там в поместье А. Вида ее окончательно снарядили и испытали. 30 апреля яхта своим ходом перешла в Вилла-Франко.
Но в исследовательских работах «Велелла» участия почти не принимала, и в первых отчетах станции упоминания о ней не встречаются. Это объясняется тем, что до 1903 г. яхта находилась в Тулоне в распоряжении «наблюдавших за постройкой».
«Велелла» имела существенный недостаток — слишком тихий ход. Установить на ней более мощные двигатели не удалось, и в 1906 г. теперь уже морской министр Григорович для зоологической станции «счел возможным разрешить приобретение специально приспособленного судна».
Яхта «Велелла» имела водоизмещение 13 т и была оснащена вспомогательным керосиновым двигателем мощностью 6 л. с, позволявшим развивать скорость до 5 узлов. Причем керосин для нее завозили прямо из России.
Сотрудничество Морского ведомства и станции продолжалось до 1914 г. Затем станция перешла в ведение исключительно Министерства народного просвещения. Однако право собственности сохранялось за Морским ведомством.
После революции 1917 г. централизованное финансирование станции прекратилось, и она существовала на субсидии Пражского, Варшавского и Белградского университетов, оставаясь в собственности России. В 1924 г., после признания Францией СССР и отказа советского правительства платить царские долги, французское правительство секвестрировало станцию и все ее имущество и передало ее Министерству общественного просвещения.
В ноябре 1932 г. декретом президента станция была окончательно передана в собственность Парижского университета, где она и находится по сей день.