На фронт Савицкий попал в ноябре 1941 г. на стажировку. В первом же боевом вылете сбил Ме-109, но и сам попал под удар — спасла бронеспинка. Под Новый год его вызвал командующий Западным фронтом Г.К. Жуков и приказал уничтожить здание, где располагался штаб немецкого корпуса. Несмотря на сложные погодные условия, майор чётко провёл результативную штурмовку.
Летом 1942 г. полковник Савицкий был назначен командиром 205-й ИАД. С новым назначением он потерял в должности, но попал в действующую армию. С момента возвращения на фронт Савицкий воевал исключительно на «Яках», в совершенстве освоив все типы истребителей этой марки.
В боях под Харьковом и Сталинградом он проявил себя зрелым и грамотным командиром.
В начале 1943 г. Савицкий был назначен командиром 3-го ИАК и приступил к формированию этого соединения. В начале апреля его вызвал В.И. Сталин, который обрисовал задачи корпуса в грядущем сражении, и уже 20 апреля в составе 4-й ВА лётчики корпуса провели свои первые бои, сбив за день 47 самолётов противника. Один неприятельский бомбардировщик уничтожил сам командир корпуса. А через неделю его Як-1 был сбит очередью стрелка Ю-87. Савицкий приводнился с парашютом. Ему повезло: он был подобран советским катером в море, неподалёку от своего родного Новороссийска.
В составе Южного, позднее 4-го Украинского фронта 3-й ИАК под командованием уже генерал-майора Савицкого участвовал в боях на реке Молочной, под Никополем, в Крыму. За 107 боевых вылетов и 15 самолётов противника, сбитых к марту 1944 г., ему было присвоено звание Героя Советского Союза.
Вечером 11 мая 1944 г. в воздушном бою над мысом Херсонес самолёт Савицкого, атаковавший Ме-109, был подбит прямым попаданием зенитного снаряда. Он сумел дотянуть до своей территории и посадил машину на фюзеляж. В результате — компрессионный перелом трёх позвонков. Вечером того же дня он узнал о присвоении ему воинского звания генерал-лейтенанта.
Из Крыма корпус Савицкого был переведён в Белоруссию, где принял участие в поддержке с воздуха частей, занятых в операции «Багратион». Позднее его лётчики обеспечивали прикрытие и поддержку 5-й армии и 3-го гвардейского механизированного корпуса, осуществлявших наступление на Вильнюс.
В ходе Висло-Одерской операции его корпусу, только что полностью перевооружённому на Як-3, было поручено прикрытие переправ через Вислу. В условиях быстрого наступления советских войск вопросы базирования возникали весьма остро. В паре со своим ведомым С. Самойловым он неоднократно лично разведывал новые аэродромы и площадки, опробовал их пригодность. В Восточной Пруссии во время весенней распутицы несколько полков корпуса взлетали и садились на участок шоссе, длина и ширина которого были вдвое меньше нормативных требований. Первым с импровизированного аэродрома взлетел Савицкий.