После полёта первого спутника, запущенного в СССР, ускоренными темпами стала развиваться программа «Меркурий». При этом планировалось запустить капсулу с человеком по баллистической траектории. Эта капсула была идеей широко известного в воздушных силах бригадного генерала Дона Фликингера. Проект Фликингера получил название «В космос — скорее». Сидящий в капсуле являлся объектом аэромедицинского исследования, и не более того. По замыслу Фликингера, в первых полётах в капсуле должен был находиться шимпанзе. Фликингер, естественно, стал одним из тех пятерых, кому поручили отобрать для «Меркурия» астронавтов — так они должны были называться. То, что NASA вот-вот начнёт отбирать людей для полёта в космос, не предавалось гласности, но Скотт Кроссфилд об этом знал. Кроссфилд, Фликингер и ещё семь человек были избраны в особый комитет по подготовке к космическим полётам. А ведь Кроссфилд знал Фликингера давно. Он познакомился с ним ещё при испытаниях компенсирующих костюмов во время работы по проекту «X-15». Теперь он подошёл к генералу и прямо сказал, что хочет стать астронавтом. Фликингер не просто любил Кроссфилда, а восхищался им. И он ответил:
— Скотти, даже не пытайся, тебе откажут. Ты слишком независимый.
Теперь, когда Йегер покинул Эдвардс, Кроссфилд оставался самым опытным и многообещающим из пилотов, летавших на реактивных самолётах и ракетопланах. Фликингер рассказал ему, что проект «Меркурий» не подходит для лётных братьев прошлых лет, когда не было ни начальства, ни корреспондентов, когда пилот с бортинженером забивались в ангар, а потом поднимали машину в воздух, долетая почти до звёзд, приземлялись на дне высохшего озера и вечером заходили к Панчо попить пивка. Фликингер объяснил, что первым в космос должен полететь шимпанзе. Ну что ж, всё ясно, Кроссфилда это больше не интересовало.
В 1960 г. Кроссфилд поставил новый рекорд скорости, пролетев на ракетоплане X-15, запущенном с бомбардировщика B-52, со скоростью 2,97М и достигнув высоты в 25000 м. 8 июня 1960 г. во время проведения наземных испытаний двигателя XLR-99, из-за короткого замыкания в проводке, раздался сильнейший взрыв. Кроссфилд находился в кабине ракетоплана, в двух метрах от эпицентра и, единственный из присутствовавших на площадке специалистов, за исключением лёгкой контузии, совершенно не пострадал.
15 ноября 1960 г. он совершил на X-15 с двигателем XLR-99 первый полёт. Совершив на этом ракетоплане ещё два полёта, он предлагал совершить такой полёт на X-15, чтобы разогнать его до 1-й космической скорости и выйти в космос. Едва ли это было возможно, и генералы строго пресекли попытку, сказав что-то вроде: «Оставайся в небе и не лезь в космос».