Учредил акционерное общество Волжско-Каспийское пароходство «Кавказ и Меркурий».
В 1870 году создал Волжско-Камский коммерческий банк, который до 1917 года оставался крупнейшим по размерам капитала банком в России.
Вместе с П.П. Губониным построил уральскую горнозаводскую дорогу.
Создал: «Русское общество пароходства и торговли» (1856); Волго-Донскую железную дорогу (1858); Товарищество Московско-Курской железной дороги (1871); Общество Уральской железной дороги (1874).
Один из учредителей Московского купеческого банка.
Основал «Северное общество страхования и склада товаров с выдачей варрантов» — освоен еще один новый вид бизнеса, страхование.
Создал Северное телеграфное агентство (1870), став, получается, первым «медиамагнатом» в России.
Инициатор проведения конки — конно-железной дороги, связавшей центр Москвы через Мясницкую с тремя вокзалами на Каланчевской площади.
Построил в Москве крупный гостинично-складской комплекс, неофициально названный «Кокоревское подворье» (1865), предшественник нынешних бизнес-центров, стоимостью более 2,5 миллиона рублей. Одно из первых зданий Москвы, получившее электрический свет (1883), «Кокоревское подворье», стало крупным культурным центром, привлекшим таких людей, как художники Крамской, Верещагин, Репин, Поленов, Васнецов, композиторы Чайковский, Аренский, писатели Мельников-Печерский, Мамин-Сибиряк.
Сегодня здесь бизнес-центр «Царев сад».
В 1862 г. на средства Кокорева был разбит липово-вязовый бульвар от Лубочного переулка до Болотной площади, один из немногих бульваров и скверов Москвы, устроенных за частный счет.
Открыл первую Московскую публичную картинную галерею (1862) в Трехсвятительском переулке.
Открыл приют под Вышним Волочком для малоимущих студентов Академии художеств, названный впоследствии «Академической дачей».
Член Комитета по оказанию помощи голодающим (1867).
Накануне Русско-турецкой войны 1877–1878 годов финансировал и экипировал военную миссию генерала Черняева на Балканах.
Содействовал распространению «Военного займа».
На рождественском банкете 27 декабря 1857 г. выступил с речью против крепостнического рабства — «тормоза прогресса». Текст ее, ходивший в списках, дошел до крестьян, так что последовавшее через три года освобождение сопровождалось слухами, что это Кокорев с друзьями-купцами Алексеевыми, Солдатенковым — просто выкупил крестьян.
Опубликовал в «Русском Вестнике» и «Русском Архиве» серию статей, вызвавших интерес всей России.
На закате жизни, в 1887 году, Кокорев пишет книгу «Экономические провалы», в которой дает оценку экономическим событиям за полвека. Анализируя экономические неудачи России, Кокорев доказывает, что они являются, как правило, результатом слепого копирования зарубежного опыта: