Итальянцы действовали над Мальтой не так активно, как прежде, и до конца месяца 261-я эскадрилья сумела заявить только три победы. В ночь с 18 на 19 декабря сержант Ф.Н. Робертсон сбил итальянский бомбардировщик, вероятно, это была первая ночная победа на Средиземноморье. До 9 января 1941 года защитники Мальты заявили 45 сбитых итальянских самолетов.
Тем временем в район Средиземноморья прибыли немецкие авиационные части. В январе 1941 года немецкий X авиационный корпус приступил к налетам на Мальту. Уже 10 января немецкие «штуки» повредили авианосец «Иллюстриес», стоявший в порту Ла-Валетты на Мальте. «Харрикейны» из 261-й эскадрильи заявили четыре сбитых Ju 87, а «Фалмеры» с авианосца перелетели на наземные аэродромы. Немецкое командование решило добить авианосец. Новый налет немецкая авиация совершила 16 января. На перехват противника вылетели четыре «Харрикейна» и три «Фалмера», которые суммарно заявили пять побед. Столько же побед заявили и зенитчики. Сильные налеты повторились 18 и 19 января. каждый раз на перехват противника вылетали истребители с Мальты. За четыре дня ожесточенных боев защитники заявили 40 побед, в том числе 23 заявили истребители. Особенно отличился флайт-лейтенант Дж. А.Ф. Маклахан. который 19 января заявил четыре подтвержденные и одну вероятную победу. 23 января авианосец «привели в чувство», и он смог покинуть опасный порт, отправившись в Соединенные Штаты для капитального ремонта.
Немцы теперь сопровождали бомбардировщики истребителями. Теперь «Харрикейнам» приходилось прорываться через строй ВГ 109Е из 7./JG 26. а позднее и III./JG 27. Степень опасности показал уже первый бой. имевший место 12 февраля. Шесть «Харрикейнов» поднялись на перехват трех Ju 88. Пока англичане набирали высоту, их атаковали Bf 109Е и быстро сбили два «Харрикейна». Третий «Харрнкейн», получивший тяжелые повреждения. с раненным пилотом в кабине, разбился при посадке в Хал-Фаре. Англичане заявили одну подтвержденную и одну вероятную победу, но в действительности немцы потерь не понесли. Хотя до конца недели удалось сбить четыре Ju 88 и один CR 42, немецкие истребители оставались неуязвимы.
Хотя на Мальте имелась радиолокационная станция, ее эффективность оставляла желать лучшего. Английских летчиков сильно угнетал тот факт, что «Харрикейн» заметно уступал «Мессершмитту» в боевых качествах, и как-то изменить эту ситуацию было невозможно. До сих пор сказывалась ложное самодовольство, вызванное легкими победами над итальянцами. 16 февраля командир звена «А» флайт-лейтенант Дж. А.Ф. Маклахан, имевший на боевом счету восемь побед, был сбит в бою с Bf 109 и получил тяжелое ранение, так что ему позднее пришлось ампутировать предплечье. Два других «Харрикейны» в том бою получили тяжелые повреждения. В течение последующих пяти дней боевой дух пилотов 261-й эскадрильи упал в еще большей степени. Столь серьезные проблемы причинили им 12 немецких пилотов из 7./JG 26.