• 30 июля 1943 года тральщик ТЩ-65 (бывший РТ-76 «Астрахань»), входивший в состав конвоя, эскортировавшего транспорт «Рошаль» от острова Колгуев в губу Белушья, торпедирован германской подлодкой U703. Из 42 членов экипажа погибли 28 человек. На советском транспорте везли шумопеленгатор для создания противолодочной обороны у мыса Желания. Гитлеровская подлодка была обнаружена за 20 минут до атаки, над конвоем в этот момент находилось 2 гидросамолета МБР-2.
• 25 августа 1943 года на минах, поставленных подлодкой U625 в проливе Югорский Шар, подорвалось и погибло спасательное судно «Шквал».
• 28 августа 1943 года транспорт «Диксон» торпедирован немецкой подводной лодкой U354 (или U302) юго-восточнее островов Мона. Экипаж и пассажиры спасены кораблями охранения.
• 6 сентября 1943 года на минах, поставленных подлодкой U636 в Енисейском заливе, по пути из Дудинки на Диксон подорвался и погиб транспорт «Тбилиси».
• 30 сентября 1943 года пароход «Архангельск» из состава каравана ВА-18 торпедирован подводной лодкой U601 в 60 милях западнее архипелага Норденшельда. Советский караван шел из моря Лаптевых в реку Енисей. Из 42 человек подобрано с воды только 29.
• 1 октября 1943 года пароход «Сергей Киров» и тральщик из состава каравана ВА-18 торпедированы у островов Арктического института подводной лодкой U703. Часть команды погибла, спасено 27 человек.
• 1 октября 1943 года тральщик ТЩ-42 (бывший РТ «Красный онежанин») из охранения каравана ВА-18 торпедирован у островов Арктического института третьей немецкой подводной лодкой U960 из арктической «волчьей стаи». Экипаж тральщика погиб.
• 12 августа 1944 года транспорт «Марина Раскова» и два тральщика охранения (почти весь состав шедшего в Диксон каравана БД-5) торпедированы немецкой подводной лодкой U365 в 80 милях западнее острова Белый. Лодка впервые в условиях Арктики применила электроторпеды. Из 354 человек пассажиров и команды «Марины Расковой» (из них 116 женщин и более 20 детей) спасено лишь 145. Всего из 632 человек, находившихся на транспорте и на кораблях охранения, удалось спасти 259.
• 26 августа 1944 года советский гидрографический мотобот «Норд» был потоплен бортовой артиллерией подлодки U957, стоявшей на якоре у острова Каминского (шхеры Минина). Прежде чем ГИСУ затонуло, немцы захватили спецпочту, сопровождавшего ее офицера связи и некоторых членов экипажа.
После войны стало известно, что нацисты практически от Диксона следили за переходом советского гидрографа к полуострову Михайлова и мысу Стерлегова. То есть они хорошо разбирались в безопасных маршрутах подхода к советским полярным станциям. Главной удачей фашистов стал захват на полярной станции на мысе Стерлегова секретных советских документов, в том числе радиошифров.