Комиссия такую работу проделала. В результате появилось еще одно постановление ГКО от 6 декабря 1944 года «О мероприятиях по слиянию АДД с ВВС». Оно предусматривало: «Сформировать 18-ю воздушную армию ВВС КА в составе четырех бомбардировочных авиационных корпусов на действующем фронте и одного вновь сформированного авиационного корпуса на Дальнем Востоке. На формирование управления 18-й воздушной армии обратить управление АДД. Командующим 18-й воздушной армией назначить А.Е. Голованова, утвердить его одновременно заместителем командующего ВВС и членом Военного совета Красной армии. Назначить: первым заместителем — Скрипко, заместителем — Буянского, начальником штаба — Перминова, главным инженером — Маркова, заместителем по тылу — Власова».
После «реструктуризации» АДД в состав 18-й ВА не вошли учебные заведения АДД, которые она получила в момент формирования из системы ВВС. К 15 декабря 1944 года в составе 18-й ВА насчитывалось 1364 исправных самолета (общее число — 1421) семи типов.
Вероятно, потому, что ни один из полков АДД не был в состоянии вести дневную воздушную разведку с фотографированием, 16 января 1945 года в 18-ю ВА из 14-й ВА Волховского фронта был переведен 742-й отдельный разведывательный авиаполк на самолетах Пе-2.
1 января 1945 года в связи с упразднением ряда авиакорпусов дальнего действия (5, 6, 7 и 8-го) 36-я и 48-я дивизии вошли в состав 1 гв. бак, 1-я, 22-я (бывшая 9-я) гв., 12-я и 50-я дивизии — в 3-й гв. бак, 53-ю и 54-ю дивизии включили в состав 4-го гв. бак, 13-я (бывшая 3-я) и 7-я гвардейские дивизии вошли в состав 2-го гв. бак.
В конце 1944 года, после возобновления серийного выпуска бомбардировщиков Ер-2, самолеты данного типа стали поступать во вновь формируемые авиаполки: 326-й, (1-я гв. бад), 327-й (2-я гв. бад), 328-й (7-я гв. бад), 329-й (8-я гв. бад), 330-й (48-я бад), 332-й (3-я гв. бад), 333-й (50-я бад). Однако новые машины поступали крайне нерегулярно, что сказывалось на боеготовности полков. В итоге в январе 1945 года все полки Ер-2 сосредоточили в 18-й (бывшей 8-й) гвардейской бад.
Начиная с января 1945 года 18-я ВА принимает участие в Восточно-Прусской операции. Цели — прежние, знакомые с 1941 года: Кенигсберг, Данциг, к ним добавились другие населенные пункты Восточной Пруссии, ставшие опорными пунктами немецкой обороны. Для их уничтожения авиаполки 18-й ВА, невзирая на неблагоприятную погоду, совершают регулярные ночные боевые вылеты.
Весной 18-я ВА переходит и к боевым действиям днем. Особых успехов в этот период не отмечено — самым большим достижением стала массированная дневная бомбардировка Кенигсберга 7 апреля 1945 года. Аэродромы немецкой авиации были блокированы, поэтому истребители противника в воздухе не появлялись. Находясь под прикрытием двух сотен истребителей, 516 экипажей бомбардировщиков 18-й ВА сбросили на крепость 3743 бомбы. Вот что вспоминал начальник штаба 18-й гвардейской бад подполковник Дубяго: