Один 150-мм снаряд разорвался над машинным отделением, вызвав небольшой пожар. Близкие разрывы вызвали аварии обоих главных гирокомпасов, в результате чего корабль совершил циркуляцию на 360°.
Хотя общие повреждения "Лайона", кроме башни "Q", были значительно менее серьезными, чем во во время боя у Доггер-банки, потери "Лайона" в Ютландском бою составили 99 убитых (48 человек умершими от ран, причиненных осколками снарядов, и ожогов, 49 только от ран осколками и два только от ожогов) и 51 раненых. После боя пятеро человек умерло от ран. Потери составляли 12,3% от численности экипажа.
В полдень 1 июня на "Лайоне" хоронили убитых. На палубе выстроились серые от усталости офицеры и матросы, проведшие на ногах сутки без еды и сна, в страшном нервном напряжении. 99 трупов лежали на палубе, готовые отправиться в свой последний путь. Поскольку корабельный священник был среди убитых, заупокойную прочитал сам командир кэптен Эрнел Четфилд. Аналогичная церемония происходила и на других кораблях флота в почти мистической обстановке молчания. Чувством скорби прониклись все – от кочегара до адмирала.
После боя на "Лайоне" в течение 4 часов проводили осмотр повреждений. С 5 по 26 июня 1916 г. крейсер находился в ремонте в Розайте, затем с 27 июня по 8 июля на верфи Армстронга в устье реки Тайн, где с него сняли башню "Q". С 8 по 20 июля он находился в сухом доке в Розайте с тремя башнями. Там закончили ремонт корпуса и замену брони.
С 21 июня по 22 сентября "Лайон" все еще без башни "Q" выходил в море в составе оперативного соединения линейных крейсеров. Башню "Q" установили во время его следующего нахождения на верфи Армстронга с 6 по 23 сентября. Во время ремонта одиночные прожектора с диаметром зеркала 610-мм временно установили побортно на задней надстройке . Кожухи дымовых труб покрыли черными и белыми полосами камуфляжа.
В ноябре 1916 г. "Лайон" стал флагманским кораблем нового командующего эскадрой линейных крейсеров контр-адмирала Пакингхема, командовавшего ей до января 1918 г. За это время крейсер совершил многочисленные выходы в море.
19 августа 1917 г. "Лайон" принял участие в операции по поиску флота Открытого моря в Северном море, но боевого столкновения тогда не произошло. 17 ноября 1917 г. "Лайон" принял участие в операции британских линейных крейсеров в Гельголандской бухте, но тогда один лишь линейный крейсер "Рипалс" вел бой с кораблями противника. В том же году с "Лайона" сняли переднюю правую группу 102-мм орудий.
В 1918 г. на кормовой надстройке установили новую боевую рубку торпедной стрельбы, а на передней дымовой трубе отдельный колпак. На башнях "Q" и "Y" оборудовали платформы для взлета легких колесных самолетов.