Если Генрих III Валуа и не полюбил свое новое королевство, то, по крайней мере, его понял: ведь некоторые польские обычаи он стал считать своими и держался их до конца жизни. Его умиляла чистота поляков, и он сам, к удивлению двора, стал принимать еженедельные ванны. Он также приказал построить в отреставрированном Лувре уборные, которых раньше не было. Они еще долго служили в качестве туалетов домочадцам королевского замка.
Возвращаясь через Вену, Венецию и итальянские города, Генрих застал Францию у порога очередной религиозной войны. 11 февраля 1575 г. он был коронован в Реймсе и через два дня обвенчался с Луизой Лотарингской, дочерью герцога Меркёра Николя Лотарингского. Брак не укротил злых сплетен о любви наряжаться в женское платье и даже о гомосексуальности короля. Генрих окружал себя красивыми юношами, которые носили женские наряды и длинные волосы и участвовали в языческих спектаклях и оргиях. Современников раздражало лицемерие Генриха, который пешком посещал парижские церкви и долго молился днем, а ночью устраивал непотребства. И даже эта правда была неполной. Частые посещения церквей и монастырей также преследовали земные цели и служили телу. Там молодой и пылкий правитель утолял свою похоть. От монашек в подарок он получал известных всей стране собак, которых обожал.
После начала правления Генрих приказал перестроить Лувр, где и поселился. Большая часть времени уходила на работу. Он уменьшил размеры двора, ограничил к себе доступ, избавляясь тем самым от толп бездельников и льстецов, которые вдоволь наедались на королевских харчах. Уставая от тяжелой работы, он оставлял Париж и уезжал с женой в ее замок Олленвиль. Ежегодно он устраивал себе каникулы, путешествуя в Лион или Авиньон. Ему не хватало только порядка в королевстве: о Франции как о едином государстве говорить было уже сложно. Распавшееся на многочисленные независимые территории, Французское королевство разделилось на Католическую лигу во главе с Гизами и многочисленные политические протестантские союзы. Несмотря на то что Генрих разрешил многие конфликты, Францию потрясали очередные волнения. В 1585 г., через год после смерти анжуйского герцога Эркюля Франциска де Валуа, младшего брата Генриха III, возродилась как феникс из пепла Католическая лига. Гизы не могли позволить, чтобы на французский трон взошел гугенот Генрих Наваррский — он был самым близким родственником короля по мужской линии и, следовательно, должен был унаследовать власть после его смерти. Вспыхнувшая через год война трех Генрихов (французского короля, короля Наварры и Гиза), по сути, стала столкновением золота: испанского на стороне католиков и английского на стороне протестантов. Вначале Генрих III, который стремился к миру и порядку, не покровительствовал никому, но в конечном счете встал на сторону Генриха Наваррского. В Париже началось направленное против короля восстание. Когда 1 августа 1589 г. Генрих Наваррский приступил к осаде непокорной французской столицы, до него дошло страшное известие. Доминиканский монах Жак Клеман, прибывший ко двору Генриха III Валуа под предлогом передачи ему важной почты, нанес монарху смертельную рану в живот.