Изображение объектов, расположенных под левым и правым объективами, сводится в одно единое изображение. Это же изображение снимают специальной камерой, встроенной в микроскоп. Линия раздела между двумя совмещаемыми изображениями перемещается.
Поляризационные микроскопы используются для исследования анизотропных объектов в поляризованном свете (проходящем и отраженном) и оснащены поляризатором для поляризации падающего на объект света, а также анализатором, анализирующим световой поток, прошедший или отраженный от исследуемого объекта. Это позволяет контрастировать бесцветные объекты, не окрашивая их химическими реактивами, т.е. не изменяя объекта. В остальном конструкция поляризационного микроскопа аналогична микроскопу МБС-10. Поляризатор располагают между осветителем и объектом, а анализатор за объектом.
Поляризационные микроскопы в КИВМИ предназначены, например, для исследования волокнистых материалов, обнаружения следов парафина в осалке пыжей патронов к охотничьим ружьям и т.д. Эта возможность возникает вследствие того, что подобные объекты изменяют плоскость поляризации света. Если падающему на объект свету придать определенную плоскость поляризации, то после прохождения или отражения от объекта разные области по-разному изменят плоскость поляризации, в результате чего в окуляре микроскопа будут иметь разную окраску.
Люминесцентные микроскопы оснащены излучателями, дающими излучение, которое заставляет люминесцировать изучаемые объекты и позволяют наблюдать их свечение. Явление люминесценции дает возможность выявлять морфологические особенности объекта, наблюдать микрообъекты, размер которых меньше разрешаемого оптикой расстояния, то есть неоднородности структуры объекта, которые находятся за пределами наблюдения обычного оптического микроскопа, например МБС-10.
Особенность люминесцентного микроскопа в том, что иногда для возбуждения люминесценции изучаемые объекты нужно обрабатывать определенными химическими составами — «активировать».
Ультрамикроскоп по своим характеристикам подобен люминесцентному микроскопу. Разница лишь в том, что обнаружение ультрамалых структурных неоднородностей основано на возникновении дифракционной картины на наблюдаемых частицах. Свечение, возникающее около частиц, естественно, также не позволяет определить их строение, размеры и форму, так как частицы таких малых размеров невозможно наблюдать при помощи обычного оптического микроскопа. Но появляется возможность выявить наличие частиц, определить их количество и концентрацию.
Ультрамикроскопы применяются для обнаружения и подсчета микроскопических и субмикроскопических частиц в газах, жидкостях и прозрачных твердых телах (например, частиц в запыленном воздухе, в загрязненной воде и др.), т.е. частиц, размеры которых лежат далеко за пределами разрешающей способности микроскопов с наибольшей апертурой. Ультрамикроскопы дают возможность судить только о наличии частиц размером до 2 нм.