Армянский язык и православная христианская религия сплачивали людей и помогали им вынести все тяготы, связанные с обживанием на новой родине. Ими были выстроены временные церкви, на смену которым были возведены кирпичные, построенные по проекту видных архитекторов — И. Е. Старова, В. В. Сазонова, В. Газирбекьяна. Из них выделялся своим величием и великолепием храм Просветителя — Сурб Лусоворич (архитектор И. Е. Старов). Остальные шесть церквей — Успенская, Вознесенская, Федоровская, Никольская, Георгиевская и одна кладбищенская — Святого Карапета — также имели свою индивидуальность. В 1867 году за проект церкви Святого Карапета В. Газирбекьян был награжден серебряной медалью и заграничной командировкой. Инженер-архитектор Василий Васильевич Сазонов занимался составлением чертежей, проектов, смет, наблюдал за строительством двух мостов через Дон, церкви Св. Карапета, трех зданий богодельни на армянском кладбище, двух рядов торговых лавок на Базарной площади. Архитектор Иван Егорович Старов работал в Санкт-Петербурге. Ему приписывается авторство проектов планировки Нахичевани, соборного храма Григория Лусоворича и церкви монастыря Сурб-Хач, церквей города, а также армянских селений на Дону.
Город украшала Александро-Невская церковь, которая отличалась не только своими размерами, но и изумительными нежно-голубыми росписями на стенах, это была одна из крупных русских церквей Юга России.
В Нахичевани работала армянская духовная семинария, а также Духовное правление Еврейского молитвенного дома. Религиозный фактор сыграл свою немалую роль. Казаки, будучи людьми глубоко верующими, придавали этому вопросу значение первостепенное. Они посещали армянские монастыри и покупали иконы армянского писания. В свою очередь армяне посещали войсковые храмы.
В конце XIX и начале XX вв. армянки стали выходить замуж за казаков, зачастую за дворян и офицеров. В делах «войсковой канцелярии» имеются прошения о принятии того или иного армянина в казачье сословие. В период военных действий в 1915–916 гг. рядом с портретами отличных казаков можно было видеть героев-армян, увешанных крестами и медалями.
Федор Сергеевич Готьян в своей повести «Антон Горбонос» так описывает совместную жизнь армян и казачества: «Живя в постоянном соседстве с украинцами и казаками, армяне много позаимствовали у них, но и сами тоже передавали им свое, издалека завезенное, — нити сплетались. Старуха-армянка рвала на себе волосы, проклиная сына за женитьбу на русской, пьяный казак волочил по сараю чуть было не сворованную «чумазым» дочь. Корни уходили вглубь, все больше и больше завязывался узел.