Тем не менее, председательствующий Митрополит Тихон установил, что кворум есть налицо. 30-го октября было установлено восстановить Патриаршество и незамедлительно приступить к выборам. Выборы начались на следующий же день.
Перед выборами Патриарха, поданными записками были намечены кандидаты, из коих главными были Архиепископ Харьковский Антоний (101 голос), Архиепископ Тамбовский Кирилл (27 голосов) и Московский Митрополит Тихон (23 голоса). Если бы Архиепископ Антоний получил абсолютное большинство, он считался бы избранным, но поскольку для этого у него голосов было недостаточно, окончательное избрание было обусловлено жребием из трёх кандидатов, получивших простое большинство голосов. Всего при первом голосовании было намечено 10 кандидатов.
5-го ноября в храме Христа Спасителя 90-летний старец Зосимовской Пустыни Алексий после усердной молитвы вынул жребий с именем Митрополита Тихона, о чём ему немедленно было объявлено особым посольством во главе с Митрополитом Киевским Владимиром. Поспешил приветствовать его избрание и Архиепископ Харьковский Антоний. В день Введения во храм Пресвятой Богородицы состоялась торжественная интронизация Патриарха Тихона в Успенском соборе.
Началась новая эра в жизни Русской Церкви. Перед наступлением жестокого гонения она уже не была обезглавленной.
Таким образом, Поместный Собор Русской Православной Церкви 1917–1918 годов не только восстановил патриаршество в России, не только избрал нового Патриарха Московского и Всея Руси, но и, что не менее важно, разработал правило такого избрания, отменить или изменить которое властен только равный ему орган управления Церковью, а именно Поместный Собор. По этим правилам Патриарх Русской Церкви, так же как и делегаты Собора от епархий на своих епархиальных собраниях, избирается независимым тайным голосованием непосредственно на Соборе, т. е. без предварительного выдвижения кандидатов в Патриархи на предсоборных совещаниях и собраниях. Лицо, получившее абсолютное большинство голосов, становится вновь избранным Патриархом. Если этого не произошло, то предстоятель Церкви определяется жребием из трёх кандидатов, получивших наибольшую поддержку при голосовании.
Как будет показано ниже, это правило, имеющее силу закона (канона) Церкви, не отменённое и не изменённое по сей день, неоднократно нарушалось, или вообще игнорировалось при последующих «назначениях» так называемых патриархов от Сергия Старгородского до Кирилла Гундяева. Уже одно это обстоятельство делает такие «назначения» неканоническими, а самих патриархов незаконными. Как показала жизнь, это нарушение церковных канонов оказалось далеко не единственной причиной считать последних лжепатриархов незаконными. Но об этом речь пойдёт ниже.