После этого повсеместно, начиная с Джакарты, началась замена английских войск голландскими. 16 апреля южная часть Бандунга была передана англичанами под контроль голландских войск. Вслед за этим, 16 мая, под контроль голландцев перешел Семаранг. С 10 июля голландцам были переданы все оккупированные союзниками районы вне Явы и Суматры. В октябре голландцы получили под свой контроль города Богор на Яве, Палембанг, Медан и Паданг на Суматре. А 30 ноября 1946 г. последний английский солдат покинул территорию Индонезии.
Голландские войска, будучи не в состоянии полностью овладеть островами Ява, Суматра и Мадура, развернули боевые действия в других районах архипелага. К июлю 1946 г. они оккупировали о-ва Калимантан, Сулавеси, Молуккские и Малые Зондские, а также архипелаг Риау и о-ва Банка и Белитунг. На всех этих территориях, слабо развитых в экономическом положении, проживало менее четверти населения Индонезии.
Тем не менее, голландские правящие круги предпринимали энергичные шаги для реализации плана раскола Индонезии, противопоставляя ей искусственно созданные на окраинах «независимые» государства, пытаясь таким образом заставить республиканцев дать согласие на создание федеративного государства «Соединенные Штаты Индонезии», состоящего из четырех частей: Ява, Сумарта, Борнео и «Великий Восток» (о-ва Сулаверси, Молуккские и Малые Зондские).[851]
Автором плана по расчленению Индонезии выступал X. ван Моок. Ссылаясь на то, что индонезийское общество неоднородно в этническом отношении, разделено языковыми, культурно-религиозными и социально-экономическими барьерами, и.о. генерал-губернатора Нидерландской Индии утверждал, что наиболее реальной для страны явилась бы федеративная система. «Чтобы не разжигать существующих разногласий… наиболее подходящей для устройства Индонезии представляется та или иная форма индонезийского содружества или Соединенных Штатов Индонезии», – утверждал ван Моок.[852] Именно с таким предложением от имени своего правительства ван Моок еще в феврале 1946 г. обратился к представителями Индонезийской Республики.
7 октября 1946 г. в Джакарте начались переговоры между голландской Генеральной комиссией и возглавлявшейся С. Шариром делегацией республики, которые завершились в марте 1947 г. подписанием соглашения о прекращении военных действий, вошедшего в историю под названием Лингаджатского.
Соглашение носило «компромиссный характер. Нидерланды признали де-факто власть Республики на Яве, Мадуре и Суматре, т. е. на территории, где проживало более 80 % населения страны. В свою очередь Республика соглашалась на создание в будущем федеративных Соединенных Штатов Индонезии (СШИ), которые в качестве суверенного государства должны были войти в голландско-индонезийский союз, а также признавала права голландских и других западных собственников предприятий, расположенных на ее территории».