В ходе эксплуатации различные варианты Ан-12 в массовом порядке оснащались следующей аппаратурой:
«Клин» (Ан-12А/Б, 1965 г .) -контроль места самолетов в боевых порядках;
«Яхта» (Ан-12БК, 1969 г .) - засекречивание переговоров экипажа с землей и другими самолетами;
75Т (Ан-12БК, 1971 г .)- обеспечение полетов по зарубежным авиатрассам;
АН-12ПП шауляйского полка с опознавательными знаками ВВС Сирии
«Демобилизованный» Ан-12ПП выполняет гражданские перевозки
Самолет Ан-12БЛ с противорадиолокационными ракетами Х-28
Заправка истребителей МиГ-19 с топливозаправщика Ан-12БКТ
Y-8A - китайский вариант Ан-12
«Звено» (Ан-12БК, 1972 г .) - пилотирование в плотных боевых порядках;
«Кремний» (Ан-12БК, 1974 г .) - дальняя навигация.
Кроме указанных основных вариантов, АН-12 имел ряд модификаций специального назначения.
Ан-12УД/УД-3 ( 1960 г .) - вариант увеличенной дальности с двумя/тремя дополнительными топливными баками (по 4000 л ) в грузовой кабине.
Ан-12ПЛ ( 1961 г .) Полярный, лыжный вариант с неубираемым лыжным шассии подогревом лыж воздухом при их примерзании для страгивания самолета с места. Построено 2 экз.
Ан-12Т ( 1961 г .) - топливовоз, предназначался для перевозки авиационных, автомобильных и ракетных топлив и окислителей в емкостях, установленных в грузовой кабине.
АН-12БМ ( 1962 г .) - вариант Ан-12Б для исследования возможности дальней радиосвязи через спутник «Молния-1». В кабине сопровождающих размещены 4 оператора аппаратуры связи. Переоборудован 1 самолет.
Ан-12БК ( 1963 г .) - поисково-спасательный вариант с аппаратурой «Исток-Голубь» пеленгования работающих аварийных УКВ-радиостанций.
Ан-12Б-И ( 1964 г .) - вариант Ан-12Б со станцией индивидуального радиоэлектронного противодействия «Фасоль». Построено 7 экз.
Ан-12БП (1968-1969 гг.) - разведчики степени радиоактивного заражения атмосферы.
Ан-12БКВ ( 1969 г .) - бомбардировщик и постановщик мин, оснащен стационарным транспортером для сброса 12 т бомб.
Ан-12Б «Кубрик» ( 1969 г .) - самолете комплексом аппаратуры для исследования инфракрасного излучения надводных, наземных и воздушных целей и испытания объектов инфракрасной техники.
АН-12ПС ( 1969 г .) - авиационно-мор-ской поисково-спасагельныи комплекс на базеАн-12Б. Предназначен для поиска и эвакуации приводнившихся космонавтов, а также людей, терпящих бедствие на море. Самолет доставляет и десантирует в акваторию спасения спецкатер типа 03473 с командой спасателей из трех человек.
Ан-12БШ и АН- 12БКШ( 1970 г .) -учебно-штурманские варианты Ан-12Б и Ан-12БК для группового обучения (10 рабочих мест в грузовой кабине) курсантов-штурманов ВТА.