В это время на борту корабля погибло 6 офицеров, в том числе командир Е. Голиков и тот самый корабельный доктор С. Смирнов. Остальные офицеры были арестованы. Были задержаны и офицеры миноносца № 267, который пытался уйти. Захватив броненосец, матросы подняли на нем красное знамя. Для руководства кораблем восставшие выбрали судовую комиссию – революционный комитет во главе с Афанасием Матюшенко. В 14.00 14 июня 1905 года команда новейшего корабля царского флота эскадренного броненосца «Князь Потемкин-Таврический» объявила его кораблем революции.
15 июня восставшие матросы привели корабль в порт Одессы, которая в то время была охвачена забастовкой. Полиция и войска были вытеснены с территории порта, который был захвачен забастовщиками. Под шум всеобщего братания одесских пролетариев и матросов местные уголовники начали громить портовые склады и винные подвалы. Начались пожары. Войска окружили территорию порта, при обстреле имелись десятки жертв.
15 (28) июня 1905 года в Одесский порт с броненосца «Князь Потемкин» был доставлен труп Григория Вакуленчука с запиской: «Перед вами лежит тело убитого матроса Григория Вакуленчука, убил старший офицер эскадренного броненосца “Великий князь Потемкин-Таврический” за то, что тот сказал, что борщ не годится. Отомстим кровопийцам! Смерть гнобителям, пусть живет свобода».
16 июня были освобождены и отпущены в город пленные офицеры и состоялись похороны Вакуленчука. При возвращении с кладбища группа матросов была обстреляна военным патрулем. В ответ броненосец послал несколько снарядов в сторону города. Дали несколько холостых и боевых артиллерийских выстрелов по кварталам, где находились здания властей. В Одессе разгоралась паника. Как действовать восставшему кораблю дальше? Ясного и четкого плана у его руководителей не было. На «Потемкине» было немало отважных людей, но не было боевого руководства, которое сумело бы сплотить всю команду в крупную революционную силу, организовать дальнейшее наступление на опорные пункты черноморского побережья. Судовая комиссия «Потемкина» решила воздержаться от высадки десанта до того времени, пока к броненосцу не присоединится вся эскадра. Царь Николай II счел восстание на «Потемкине» опасным и, не желая допустить, чтобы этот корабль крейсировал в Черном море под революционным красным флагом, отдал приказ командующему Черноморским флотом вице-адмиралу Чухнину немедленно подавить восстание – в крайнем случае, потопить броненосец со всей командой.
17 июня пять броненосцев, два крейсера, семь миноносцев, почти вся Черноморская эскадра, высланная из Севастополя под командой адмирала Кригера А.Х., приблизились к «Потемкину». Командующий флотом потребовал, чтобы революционный корабль сдался. В ответ «Потемкин» полным ходом, наведя орудия на корабли, понесся навстречу эскадре. Большинство матросов на кораблях всей душой сочувствовали потемкинцам. «Потемкин» дважды прошел сквозь строй эскадры, команды кораблей которой оказали неповиновение своим командирам, – восставший броненосец был встречен криками «ура!». А на броненосцах «Синоп» и «Георгий Победоносец» произошли волнения, причем на последнем команда арестовала офицеров и присоединилась к восставшему «Потемкину». Опасаясь восстания, командир эскадры А.Х. Кригер не решился открыть огонь по мятежному броненосцу и был вынужден спешно увести эскадру в море от мятежного «Потемкина» и подальше от революционных кораблей. 18 июня оба броненосца вернулись в Одессу.