Было так же известно, что Маргарита пыталась покинуть из-за него дом Рафаэля, окончательно разорвать свои отношения с художником. Но любовник почти насильно заставил ее вернуться обратно.
Рафаэль знал о том, что Маргарита влюбилась в него и страшно страдал. Отомстить своему сопернику он не мог, так как тот занимал в обществе и при дворе слишком высокое положение. Похоже, именно тогда Рафаэль стал работать над мистическим ангелом мщения — работой, которая считается потерянной. Все эти события происходили перед злополучным празднованием дня рождения 6 апреля.
После смерти Рафаэля по городу сразу поползли многочисленные слухи, в которых именно Маргариту называли прямой или косвенной виновницей его смерти.
Распространению слухов способствовали ученики Рафаэля, которые открыто обвиняли Маргариту в смерти учителя. Ученики художника поклялись отомстить за то, что она разбила сердце великого человека, причиняя ему страшные страдания своими изменами.
Рафаэля похоронили в Пантеоне. В ночь после его похорон Маргарита тайком сбежала из дома художника, опасаясь физической расправы со стороны учеников.
Маргарита попыталась бежать к своему любовнику, но тот ее не принял. Он бросил ее, закрыв перед ней двери своего дома, и заявил, что не желает больше принимать никакого участия в ее судьбе.
Испуганная и расстроенная Маргарита бежала к отцу, который к тому времени уже перебрался в Рим: Маргарита купила ему дом. От нее отвернулись абсолютно все. Некоторое время она скрывалась в доме отца.
А потом не придумала ничего лучше, чем попытаться примириться со своим бывшим женихом Томазо. По милости Маргариты Томазо провел в монастырском заточении пять лет.
Выйдя на свободу, он перебрался в Рим и занялся торговлей, открыл магазин и разбогател. Узнав, где он живет, Маргарита явилась к нему в дом и попыталась соблазнить его. Но Томазо бросил ей в лицо горсть земли и выгнал прочь. Он не желал больше видеть женщину, ставшую причиной самых больших несчастий его жизни.
Воспользовавшись наследством, оставленным Рафаэлем, Маргарита купила в Риме дом и вернулась к тому образу жизни, который вела уже давно. Она продолжила вести жизнь куртизанки. Почувствовав вкус беспечной сладкой жизни, побывав любовницей самых известных людей в Риме, она уже не желала что-то менять. Она продолжала вести себя как прежде — менять любовников, оставаясь известной светской куртизанкой.
Но это длилось недолго. Однажды Маргарита попросту исчезла из своего дома. Никто не знал о том, что с ней произошло, куда она пропала так внезапно. Знаменитая Форнарина бесследно исчезла из Рима.