Оп. 1. Д. 16, 20, 48, 63, 64, 65, 75, 76, 78, 80, 82, 83.
Оп. 2. Д. 607, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 616, 619, 620, 621, 629, 641, 642, 643.
6. Фонд Р-2045 (Разведывательное управление ВМФ).
Оп. 1. Д. 17.
7. Фонд Р-61 (Управление авиации ВМФ).
Оп. 4. Д. 409, 410, 411, 413.
8. Фонд Р-441 (Управление кораблестроения ВМФ).
Оп. 14. Д. 56, 63, 70, 71, 95, 113, 117, 153.
9. Фонд Р-360 (Техническое управление Военно-Морских Сил РККА).
Оп. 2. Д. 42, 109, 143.
10. Фонд Р-961 (Управление боевой подготовки ВМФ).
Оп. 1. Д. 346.
11. Фонд Р-1549 (Политическое управление ВМФ).
Оп. 1. Д. 13, 234.
12. Фонд Р-840 (Артиллерийский отдел РККФ).
Оп. 1. Д. 1639.
13. Фонд Р-920 (Инженерное управление ВМФ).
Оп. 1. Д. 94, 95.
14. Фонд Р-307 (Командование КБФ). Оп. 4. Д. 24.
Оп. 6. Д. 21, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31.
15. Фонд Р-34 (Политическое управление КБФ).
Оп. 6. Д. 663, 714, 733, 906, 928.
16. Фонд Р-62 (Управление Военно-воздушных сил КБФ).
Оп. 2. Д. 85, 86, 87,
96, 124, 150, 160, 161.
17. Фонд Р-1883 (Разведывательный отдел КБФ).
Оп. 1. Д. 4, 5, 9, 71.
18. Фонд Р-92 (Штаб КБФ).
Оп. 1 (Оперативный отдел). Д. 1005, 1012.
681, 682, 710, 711, 714, 719, 722, 754, 755, 756, 772, 774, 776.
Оп. 4. Д. 19, 995, 1075.
Оп. 5 (Отдел боевой подготовки). Д. 31, 32, 33, 35, 36, 37, 41, 42, 43, 45, 57, 64, 65, 67, 72, 76, 84, 87, 88.
Оп. 7 (Организационно-мобилизационный отдел). Д. 230, 231, 233, 248, 256, 261, 263, 268, 278, 297, 358, 362, 381, 384, 387, 414.
Оп. 22 (Отдел по личному составу). Д. 419, 420.
Оп. 23 (Отдел по личному составу). Д. 24, 31, 33, 38, 47, 65, 71, 84, 95.
Оп. 24 (Отдел по личному составу). Д. 494.
19. Фонд Р-852 (Соединения линейных кораблей КБФ). Оп. 4. Д. 24, 51, 52, 73, 74.
20. Фонд Р-1135 (Эскадра КБФ). Оп. 1. Д. 1, 3, 4, 6, 7, 11. Оп. 4. Д. 1, 2, 3, 4,
5, 6, 7, 10, 11, 12.
21. Фонд Р-103 (Соединения эскадренных миноносцев КБФ). Оп. 2. Д. 478, 505.
22. Фонд Р-929 (Отряд лёгких сил КБФ). Оп. 2. Д. 2, 7, 8, 9, 10, 15, 17.
23. Фонд Р-1600 (Охрана водного района КБФ).
Оп. 1. Д. 4, 6, 7, 8, 21, 24.
Оп. 2. Д. 7, 9, 10, 11, 14, 15, 16, 18, 22. Оп. 3. Д. 36, 44, 47, 72, 76, 79, 81.
24. Фонд Р-1960 (Бригада торпедных катеров КБФ). Оп. 5. Д. 153, 155, 160.
25. Фонд Р-1890 (Дивизион канонерских лодок КБФ). Оп. 1. Д. 1, 2, 3.
26. Фонд Р-2072 (Шхерный отряд КБФ). Оп. 1. Д. 1.
27. Фонд Р-1895 (1-й дивизион сторожевых кораблей ОВР КБФ). Оп. 1. Д. 4.
28. Фонд Р-1911 (1-й дивизион тральщиков ОВР КБФ). Оп. 1. Д. 1, 2, 4, 7. Оп. 2. Д. 13.
29. Фонд Р-2163 (Охрана Балтийского водного района КБФ). Оп. 1. Д. 3.
30. Фонд Р-107 (Подводные силы КБФ). Оп. 2. Д. 23, 24, 59, 60, 61, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 89, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 120, 122, 125, 126, 135, 152. Оп. 3. Д. 78, 79.