В 1593 г. на нижней Оби был построен город Березов, от которого началось продвижение вверх и вниз по великой реке.
В 1597 г. сольвычегодец Артемий Бибиков открыл короткую сухопутную дорогу от Соликамска в верховья реки Туры. В следующем году был основан город Верхотурье. Но московские воеводы решили перехватить инициативу поморских промышленников и взять богатые края под свой контроль.
В 1600 г., в царствование Бориса Годунова, московское правительство снарядило большую экспедицию под начальством князя Мирона Шаховского для покорения Мангазеи. Это войско пробиралось через тундру на оленях. Население тундры при поддержке промышленников разгромило пришельцев. В следующем году поход из Москвы повторился, и на реке Таз, на месте уже существовавшего селения промышленников, по приказу Бориса Годунова был заложен торговый город Мангазея. Город был окружен стеной с пятью башнями.
В Мангазею стекались не только купцы, но и люди, бежавшие от государственных податей, укрывающиеся от долгов и от суда. Постоянное население составляло всего около ста человек, а временно проживало до тысячи.
В 1607 году у впадения Турухана в Енисей возникло Туруханское зимовье, которое сделалось местом оживленной пушной ярмарки. В 1676 г. туда была перенесена резиденция мангазейских воевод – возникла Новая Мангазея. Существующий и поныне город Туруханск расположен как раз на месте Новой Мангазеи.
Плавание в Мангазею совершалось на «кочах» – небольших, добротно сколоченных судах грузоподъемностью около 6–7 тонн. Путь начинался в устье Печоры, потом плыли по Карскому морю к западным берегам Ямала и дальше на север до озер, из которых река Мутная берет свое начало. Озерами и протоками доходили до реки Зеленой, а по ней уже сплавлялись на Обскую губу. Затем сворачивали в Тазовскую губу и по реке Таз плыли до Мангазеи. Не всегда плавания в Мангазею проходили удачно: нередко встречные ветры или тяжелые льды заставляли возвращаться обратно.
Нелегким был этот путь, занимавший около трех недель, но каждый год несколько кочей его проходили. В 1601 году – 4 коча (40 человек), в 1610-м – 16 кочей (160 человек), в 1613-м – 17 кочей… А бывало и по 50 кочей в год. Везли хлеб, всякие прочие товары.
Торговое мореплавание из Поморья в Обскую губу было в 1619 г. насильственно прекращено правительственным указом. Москва опасалась, что рано или поздно иностранцы станут плавать по Оби, минуя порт в Архангельске, дававший государству большой доход.
Поморы вначале просили, чтобы «из Мангазеи в Русь и в Мангазею с Руси ходить большим морем по-прежнему, чтоб впредь без промыслов не быть», однако в итоге они были вынуждены подчиниться.