В 1935 году на основе МСДВ был сформирован Тихоокеанский флот, главная морская база которого была расположена во Владивостоке. В 1936–1938 годах в состав ТОФ были переданы несколько кораблей из состава Балтийского и Черноморского флотов. ТОФ стал силой, способной решать серьезные оперативно-стратегические задачи и вести разведку как в своих интересах, так и в интересах Разведывательного управления.
В годы Великой Отечественной войны силы Тихоокеанского флота находились в постоянной боевой готовности к отражению возможной агрессии со стороны Японии. 147 тысяч моряков ТОФ принимали участие в битве под Москвой, в Сталинградском и Курском сражениях, а также в других операциях войск Красной армии на различных советско-германских фронтах.
В 1930–1939 годах разведка Главного штаба Наркомата ВМФ СССР и флотов входили в состав Разведывательного управления Генерального штаба Красной армии. Этим и объясняется то, что Бурлаков, офицер Разведуправления, приказом Я. Берзина был назначен на должность начальника отделения разведывательного отдела штаба Тихоокеанского флота. Отделение было секретным, и связано оно было с организацией агентурной работы в Японии, Корее и в Китае.
В 2006 году мне довелось встретиться с представителями разведки ТОФ, и они сообщили, что в 1936 году Леонид Бурлаков был начальником разведывательного отдела штаба ТОФ. Фамилию Бурлакова в штабе флота не забыли и до сих пор вспоминают его как активного организатора агентурной разведки Тихоокеанского флота. Это делает честь военным морякам-дальневосточникам.
В июле 1936 года Леонид Яковлевич Бурлаков был вызван в Москву. Связано это было с тем, что опытный офицер агентурной разведки, хорошо знавший Дальний Восток и свое дело, потребовался на преподавательскую работу.
Бурлаков с присущей ему энергией и инициативой начал заниматься новым для него преподавательским делом. Какой из него получился преподаватель, документальных свидетельств найти не удалось. Возможно, они и есть, но хранятся в архиве НКВД, куда Бурлаков попал 20 сентября 1938 года в качестве подозреваемого в шпионской деятельности в пользу конкретного иностранного государства — Японии. К этому времени были арестованы многие коллеги Бурлакова по совместной работе на Дальнем Востоке. Среди них был и Христофор Салнынь, «Гришка», который выполнял особо ответственные задания начальника военной разведки во многих странах Западной Европы, Америки и Дальнего Востока. Салнынь был арестован 21 апреля 1938 года и вскоре расстрелян.
Бурлаков от всех предъявленных ему обвинений отказался. Несмотря на допросы с пристрастием, он твердо стоял на своем и отказывался подписывать фальсифицированные обвинительные документы. Беседы на Лубянке со следователем продолжались с сентября 1938-го по сентябрь 1939 года. Точных данных пребывания Бурлакова на Лубянке нет, но есть точные сведения о том, что выбить из него ложных признательных показаний о сотрудничестве с японской разведкой следователи не смогли.