По мнению К. Куна, уже к началу неолита в Юго-Восточной Азии распространилось значительное число монголоидных генов. Но он все же считал, что основная волна монголоидов распространилась в результате ханьской экспансии на рубеже новой эры [279, с. 416]. В таком случае еще 2000 лет назад в материковой части Юго-Восточной Азии могла сохраниться довольно крупная австралоидная популяция. По-видимому, так оно и было. Даже в китайском описании населения индианизированного царства Фунань в Камбодже (250 г. н. э.) содержится много упоминаний о темной коже и вьющихся волосах [1043, с. 254], хотя современное население Кампучии почти целиком относится к монголоидному фенотипу. Приведенная реконструкция опирается на малочисленные палеоантропологические данные, но в целом вырисовывается довольно связная картина. Многие скелеты хоабиньского времени из Северного Вьетнама, Таиланда и с Малаккского полуострова имеют смешанный монголоидно-австралоидный облик [947; 946; 378; 1181, с. 31; 1070; 1166; 1395, с. 16–18; 1383; 766]. По-видимому, речь может идти о клинальной изменчивости с вероятным преобладанием австралоидных черт на полуострове. Однако, за исключением факта появления монголоидного населения в Западном Таиланде к 2000 г. до н. э. [1166], у нас почти нет палеоантропологических данных о монголоидной экспансии на материке в неолите. Таким образом, остается вернуться к предположениям, высказанным в предыдущем абзаце.
В Индонезии и на Филиппинах монголоиды распространились в ареале, который прежде был австралоидным. Выше уже упоминался австралоидный череп из пещеры Ниа в Сараваке. Помимо него в той же пещере было найдено несколько донеолитических погребений, возраст которых — 17—6 тыс. лет; зубная система останков отличалась «меланезоидными» чертами [817; 666; 648]. Погребенные из вышележащих неолитических слоев имели уже монголоидную зубную систему. Они датируются концом II–I тысячелетием до н. э.
Т. Джекоб детально проанализировал много палеоантропологических останков с о-вов Ява, Сулавеси и Флорес [766], хотя только некоторые из них были увязаны с надежным археологическим контекстом. К меланезийскому и австромеланезийскому типу Джекоб отнес скелеты и другие останки со стоянок Восточной Явы и Флореса. Стоянки относятся, видимо, к раннему неолиту, а палеоантропологические останки в целом — к австралоидной группе. Методом радиоуглеродного анализа было установлено, что возраст одной из стоянок Флореса — 1600 лет до н. э., но это не решает вопроса о монголоидной волне, ибо на Флоресе до сих пор обитает население с австралоидными чертами. Большее значение имеют находки в пещере Гуа-Лава около Сампунга на Яве, так как в этом районе сейчас преобладают монголоиды, однако отсутствие датировки не позволяет делать какие-либо выводы. Зато мы можем дополнить наши данные серией из 2682 зубов, найденных в пещере Леангкаданг на юге Сулавеси. Джекоб назвал их безусловно монголоидными. В Леангкаданге был найден комплекс тоалских отщепов и пластин, которые датируются примерно 5000 г. до н. э., однако, учитывая аналогичные находки с других местных стоянок, можно предположить, что зубы относятся к периоду не ранее I тысячелетия до н. э. Данные Т. Джекоба позволяют считать, что в донеолитическую эпоху индонезийское население в своей основе было австралоидным, но уже в ранние периоды голоцена, вероятно, через Филиппины сюда начали проникать монголоиды.