Тем не менее их гибель приближалась — из-за событий, которые происходили в Европе.
После казни Карла I Великобритания все больше попадала под власть жестокого, но эффективного правителя Оливера Кромвеля. В намерения Кромвеля входило вернуть стране статус великой державы на море, который был у нее во времена Елизаветы I. Этому мешали голландцы, которые теперь контролировали большую часть мировой торговли. Поэтому 9 октября 1651 года Кромвель заставил Парламент принять Навигационный акт. По этому новому закону все товары, ввезенные в Англию по морю, должны перевозить английские корабли (с английским судовладельцем, английским капитаном и английским экипажем) или на кораблях тех стран, где произведены эти товары. Это было сделано, чтобы исключить посредников-голландцев, которые закупали товары в одной стране, доставляли их в другую и брали хорошие деньги за свои услуги.
Естественно, то, что было законом в Англии, было законом и в ее колониях, а это означало, что поселенцы в Америке должны были плавать на английских судах, даже когда более многочисленные голландские суда и более искусные голландские капитаны обошлись бы дешевле. То, что считалось полезным для Англии, наносило экономический вред колониям, но это не беспокоило английское правительство. В то время считалось само собой разумеющимся, что колонии основаны и поддерживаются главным образом ради получения прибыли на родине.
Колонисты ничего не могли поделать с Навигационным актом, разве только игнорировать его, и они продолжали торговать, как им заблагорассудится, и пользоваться судами по своему выбору. Это положило начало долгой традиции контрабанды (незаконной торговли) со стороны английских колонистов, которые пытались обойти те неудобства, которые им навязывала их родина.
Англичане обнаружили, что с контрабандой они тоже ничего не могут поделать. Они находились слишком далеко. В то время пять тысяч километров океанской воды были отличным изолятором. На путешествие туда и обратно уходило три месяца.
Причину того, что Навигационный акт не действует в отношении колоний, англичане видели в наличии в нем слишком большого количества лазеек. Поэтому этот закон постоянно совершенствовали, даже после времен Кромвеля. В 1660 году приняли закон, что корабли, торгующие с Англией, должны быть построены в Англии или в ее колониях. В 1663 году постановили, чтобы все корабли из других стран, везущие товары этих стран в колонии, делали остановку сначала в Англии (это давало Англии определенную прибыль посредника за счет более высоких цен для колонистов). Более того, количество товаров, подпадающих под действие Навигационного акта, постоянно увеличивалось, и колонии должны были продавать такие товары, как сахар, табак, рис, патока, пушнина и т. д., только Англии (и, следовательно, по той цене, которую соглашались платить английские купцы).