Гностические высказывания об Иисусе также проливают свет на его довольно необычный способ обучения. В отличие от большинства учителей, он полагался на нечто большее, нежели идеи, и делал больше, чем просто убеждал в соответствии с традиционными моральными и религиозными направлениями. Он адресует свое учение не столько думающему разуму и эмоциям людей, сколько их зарождающемуся интуитивному гнозису. Его слова не столько предназначены для информирования, сколько для стимуляции скрытых творческих и созидательных способностей. Иисус, возникающий в этих проповедях, есть Иисус, сильно отличающийся от традиционного смиренного и тихого мужчины в печали. Этот Иисус использует метафоры и мифы, загадочные мистические изречения и явно гностические притчи, чтобы вызвать необычные состояния сознания у своих последователей.
Целый ряд высказываний в Евангелии от Фомы показывает Иисуса как учителя, настойчиво стремящегося к стимулированию гнозиса у своих учеников. Он укоряет последователей за попытки обращения к его роли и личности на основании прошлых пророчеств:
57. Ученики его сказали ему: Двадцать четыре пророка высказались в Израиле, и все они сказали о тебе. Он сказал им: Вы оставили того, кто жив перед вами, и вы сказали о тех, кто мертв.
Он как бы говорит: не оценивайте меня с точки зрения прошлого, не связывайте меня с пророчествами, писаниями и надеждами. Смотрите на меня вместе с гнозисом и обретете понимание. В том же источнике мы находим:
64. Иисус сказал: Посмотрите на того, кто жив, пока вы живете, дабы вы не умерли, - ищите увидеть его!
А также:
95. Они сказали ему: Скажи нам, кто ты, чтобы мы поверили в тебя. Он сказал им: Вы испытываете лицо неба и земли; и того, кто (что?) перед вами, - (как) испытать его.
Все эти заявления – призыв к непосредственному интуитивному пониманию экзистенциальной сущности и отбрасыванию концептуальных, интеллектуальных объяснений.
Гностические писания показывают, что, по крайней мере, в некоторых случаях, Иисус на самом деле пробудил гнозис в последователях. В 14 стихе Евангелия от Фомы он просит учеников рассказать, на кого он похож. Петр сравнивает его с ангелом справедливым. Матвей уподобляет его мудрому философу. Только Фома отказывается делать какие-либо сравнения и говорит, что его уста не могут сказать, на кого похож его учитель. Тогда Иисус отвечает Фоме:
Я не твой господин, ибо ты выпил, ты напился из источника кипящего, который я измерил.
Затем Иисус отводит Фому в сторону и шепчет три слова на ухо. После этого, другие апостолы спрашивают у Фомы, что это были за слова. Фома же отказывается говорить им, поясняя: