Его штатное расписание было утверждено приказом Председателя СБУ №0141 от 7 августа 1998 года. На базе отделов ПС Управлений СБУ в регионах были образованы номерные Региональные подразделения ДСТСЗИ СБУ (в дальнейшем – Отделы ДСТСЗИ СБУ в областях) как отдельные воинские части. Начальником ДСТСЗИ и заместителем председателя СБУ стал полковник Лазарев Григорий Петрович.
На ДСТСЗИ были возложены задачи по криптографической и технической защиты информации (далее – КТЗИ) в телекоммуникационных и информационных системах, создание новых средств защиты информации и специальной связи, разработки нормативно-правовых актов по вопросам защиты информации, лицензирование предпринимательской деятельности в этой области, создания органов и лабораторий по сертификации средств КТЗИ, для чего были образованы Главные управления КТЗИ (ГУ ТЗИ, ГУ КЗИ).
«Положение о порядке осуществления КЗИ в Украине» (утверждено Указом Президента №505 от 22.05.98), а также «Положение о ТЗИ в Украине» (утверждено Указом Президента №1229 от 27.09.99) стали правовой основой для осуществления возложенных на ДСТСЗИ задач.
На выполнение нормативно-правовых актов Президента и Кабинета Министров Украины в сфере КТЗИ, защиты информационного пространства и информационных ресурсов государства ДСТСЗИ была образована государственная система соответствующего контроля в виде Инспекции по вопросам защиты информации.
Специалистами Инспекции и региональных подразделений ДСТСЗИ был налажен осмотр оборудования иностранных инспекционных групп, прибывающих на территорию Украины согласно международных договоров о сокращении и ограничении вооружений, специальный осмотр помещений на наличие технических каналов утечки информации, надзор за соблюдением установленного порядка использования радиочастотного ресурса в системе СБУ и обеспечения электромагнитной совместимости радиоэлектронных средств.
Несмотря на то, что реальную угрозу для информации, содержащей государственную тайну, а также служебной и конфиденциальной информации, составляет разведывательная деятельность иностранных спецслужб. Поэтому ДСТСЗИ была разработана «Модель технических разведок» (ТР-2015).
В Модели приведены данные об иностранных средствах космической, воздушной, наземной и морской разведок. Кроме того, описаны способы ведения технической разведки на территории Украины и угрозы для информационных систем.
С целью противодействия техническим разведкам, установления единого порядка организации противодействия и определения задач, функций и обязанностей органов государственной власти и военных формирований ДСТСЗИ в 2000 году было разработано и введено в действие «Положение по противодействию техническим разведкам».