Когда программа МХ-774 была закрыта, на столе Боссарта лежали чертежи новой двух-ступенчатой ракеты. Первая ступень состояла из пяти ЖРД с тягой по 9000 кг, а вторая — из одного ЖРД с тягой 9000 кг. Ракета предназначалась для исследований входа в атмосферу при скорости, соответствующей числу М=18. Но военное ведомство не проявило интереса к этому проекту. Главным приоритетом для ВВС стала программа разработки стратегической крылатой ракеты Navaho, фирмы North American.
Финансирование выделили только под разработку наиболее сложной части радиоинерциальной системы наведения для перспективной межконтинентальной баллистической ракеты (МБР). По мнению специалистов Convair, такой частью была система слежения за ракетой, выдающая исходные данные для вычисления поправок к траектории на радиоуправляемом участке полета.
Разработка следящей системы с обозначением AZUSA началась 1948 году и завершилась в 1951 году, когда у военных вновь возникла необходимость в МБР.
В этот период Боссарт занимался чисто теоретическими изысканиями в ракетной области, на средства фирмы. В 1949 году его группа разработала проект так называемой полутораступенчатой ракеты. У нее имелся маршевый двигатель и несколько ЖРД, выполняющих роль стартовых ускорителей. На старте включались все двигатели. При достижении заданной скорости ускорительные ЖРД выключались и сбрасывались, а маршевый двигатель выводил ракету на траекторию полета к цели. Такое решение позволяло отказаться от сложных и ненадежных систем запуска двигателей второй ступени в полете.
Интерес США к баллистическим ракетам вновь возник осенью 1949 года. Толчком к этому послужило испытание ядерной бомбы в СССР. Началась ядерная гонка. 31 января 1950 года президент Гарри Трумэн публично объявил, что США начинают разработку водородной бомбы. По оценкам ведущих ученых из Лос-Аламоса, вес этого боеприпаса не позволял доставлять его к цели на борту бомбардировщика, и единственным средством термоядерного нападения становилась ракета.
В январе 1951 года ВВС США выдали фирме Convair техническое задание на разработку носителя. Программа получила обозначение МХ-1593. Ее целью было исследование всех систем и разработка технологий, ведущих к созданию МБР. Боссарт назвал будущую ракету Atlas, в честь греческого бога, который держал небо, правда, фирма Convair предлагала и другие варианты: Boxcar (грузовой вагон) или Hot Rod (горячий стержень), но Atlas понравился всем, и 21 августа 1951 года именно это имя утвердили военные.
Требования к ракете казались невыполнимыми. Например, предполагаемый вес криогенной термоядерной боеголовки составлял 65 тонн.