Проблема взаимоотношений между казаками и КОНР продолжала досаждать немцам и русским до последних дней войны. Слишком неблагодарным делом было расхлебывать чрезвычайно сложную фракционную борьбу среди казаков – родовую, про- и антинацистскую, про- и антирусскую, панказачью и сепаратистскую. В то время как старый пронацистский генерал Петр Краснов, возглавлявший казачье представительство в Берлине, обвинял Власова в «продаже России евреям» и в том, что он остался «в глубине души большевиком», большинство так называемых казачьих войск приняло руководство КОНР. Даже немецкий командир казаков фон Паннвиц сообщил, что, несмотря на то что его войска лелеяли собственные традиции, о политическом сепаратизме они не помышляли и около 95 процентов казаков считали Власова своим лидером. С другой стороны, формальное слияние казачьего личного состава с КОНР и переход казачьих войск под командование Власова затянулись на несколько месяцев. Кульминационный момент наступил, когда лидеры одной фракции генералы Науменко и Доманов (ранее присягнувшие Гитлеру) 22 марта 1945 г. признали командование Власова над собой и своими людьми – шаг, достигнутый отчасти по настоянию генерал-губернатора Истрии обергруппенфюрера СС Глобочника. В то время как некоторые казачьи офицеры держались до конца, к окончанию войны интеграция корпуса в КОНР теоретически была достигнута, хотя на практике она оказалась довольно незначительной.
Этот утопический проект являлся отражением атмосферы отчаяния, а также трений между немцами и власовцами и стремления последних избежать выдачи Москве.
И вот наступила развязка драмы – возвращение в Прагу. Когда чехи подняли восстание, чтобы стряхнуть шесть лет немецкой оккупации, они обратились к силам КОНР, дислоцированным около 50 км от Праги, чтобы те присоединились к ним. Сам Власов, по-видимому «не желая предавать во второй раз», был весьма удручен и, вероятно, пьян до потери сознания. Тем не менее он предоставил Буняченко карт-бланш – действовать по своему усмотрению и как ему велит совесть. 7 мая 1945 г., когда переговоры о капитуляции между немцами и союзниками были близки к завершению, прежние «унтерменши» в порыве столь долго подавляемой обиды и надежды с боем прорваться от измены к свободе присоединились к чешским патриотам, чтобы изгнать из Праги эсэсовцев. Американские войска остановились к западу от столицы, а когда с Востока подошла Красная армия, оказавшиеся в затруднительном положении чехи теперь попросили людей Буняченко покинуть город, который те помогали освободить. Сезон охоты на власовцев должен был вот-вот открыться.