Одновременно президент выразил резко негативное отношение к свободным профсоюзам, которые, в отличие от «официальных профсоюзов» (ФПБ), занимались истинно профсоюзной деятельностью. Они защищали права наемных работников, являлись оппонентами администрации предприятий и государства как основного хозяина средств производства. Такую деятельность Лукашенко назвал «политической», направленной на «дестабилизацию» ситуации в стране.
Вполне логично, что первая серьезная реформа, которую осуществил президент, касалась не экономики, а системы власти. Он предпринял реформу местного управления. Дело в том, что политическая система Беларуси представляла собой странный симбиоз трудно совместимых элементов: института президентства и Советов. Согласно закону, руководители регионов (председатели облисполкомов, райисполкомов и т. д.) избирались Советами соответствующего уровня и работали на основе принципа «двойного подчинения», т. е. подчинялись избравшему их Совету и вышестоящему исполкому.
Лукашенко предложил создать «вертикаль исполнительной власти» как средство восстановления управляемости страны. Согласно его проекту, президент предлагает областному Совету кандидатуру на должность председателя облисполкома, а депутаты голосуют. В свою очередь председатель облисполкома предлагает районному Совету кандидатуру председателя райисполкома. Глава государства пригрозил парламенту, что если тот откажется поддержать его предложения, то он будет искать иные пути их реализации.
Президент и его оппоненты апеллировали к Конституции, которая трактовала местное управление весьма противоречиво. 21 ноября Конституционный суд, рассматривавший этот вопрос, признал создание президентской вертикали соответствующим Основному Закону.
В результате реформы местного управления была создана исполнительная вертикаль, укрепившая власть президента. Но одновременно она вытеснила местное самоуправление на периферию общественной жизни, привела к возрастанию роли государства за счет ущемления прав гражданского общества. Объективная потребность в реформировании Советов реализовалась не в виде замены Советской власти муниципальной, а на путях антидемократического усиления центральной власти за счет сокращения полномочий местного самоуправления.
Очень скоро в полную силу проявилась одна из черт характера Лукашенко, ставшая фирменным знаком его политического стиля, - конфликтность. Эта особенность личности первого президента, умноженная на его властные полномочия, имела роковые последствия для политической системы и вообще для общественной жизни Беларуси. Как прозорливо писал В. Ленин о грубости И. Сталина, «это такая мелочь, которая может получить решающее значение». Призывы к гражданскому согласию, объединению усилий всех политических сил, прозвучавшие из уст президента в первые дни его правления, при появлении первых же проблем были быстро забыты. Как отмечали Г. Дракохруст, Ю. Дракохруст и Д. Фурман в книге «Белоруссия и Россия: общества и государства», «Лукашенко сразу же начинает бороться. И бороться не столько «за» что-то, сколько «против» - против всех сил, ...ограничивающих его власть». Например, в выступлении по телевидению 11 ноября 1994 года президент обвинил всех: коммунистов, националистов, центристов, Верховный Совет, Конституционный суд, руководителей регионов, СМИ, партии. Даже созданное им же самим правительство он обвинил в саботаже.