В связях с этой организацией были обвинены и проходившие по делу «Еврейского Антифашистского комитета». Огласка дела местами приобрела чисто антисемитский характер и влилась в более общую кампанию, инспирированную главным идеологом «борьбы с безродным космополитизмом партии» Ждановым. Активная фаза этой борьбы проходила в 1947–1953 годы.
Об этом известило страну январское сообщение ТАСС, и доклад на торжественно-траурном заседании, посвященном памяти В. И. Ленина, секретаря ЦК КПСС Н. М. Михайлова. Он заявил:
«…Скрытые враги, поддерживаемые империалистическим миром, вредили и будут вредить нам и впредь. Именно об этом говорит дело группы врачей-вредителей — подлых шпионов и убийц, спрятавшихся под маской врачей, продавшихся рабовладельцам-людоедам из США и Англии…»
Надо отметить, что Сталин лично проверял ход разбирательства по делам «военной оппозиции» — заговора Тухачевского, Корка и Якира. Детально он знакомился с материалами дел на Меркулова, Новикова, Шахурина, Кузнецова, Вознесенского и, конечно же, врачей. Для этого он трижды просил Абакумова подтвердить, что врачи Лечебно-санаторного управления Кремля невиновны. А когда Сталин в третий раз услышал от главы МГБ какие-то невнятные объяснения, он посчитал это за трусость или даже ложь. После этого участь Виктора Семеновича была предрешена. Обман Сталин не прощал.
Начиная с 1952 года, когда В. С. Абакумов уже томился в тюрьме, «Дело врачей» разрабатывалось органами с новым, прохрущевским руководством МГБ под пристальным вниманием подполковника М. Д. Рюмина, написавшего в 1951 году донос Сталину о «сионистском заговоре» в органах государственной безопасности.
29 октября 1952 года руководитель МГБ Игнатьев доложил Сталину, что эксперты — специалисты-медики подтвердили факт преступного лечения кремлевских руководителей. Сталин, читая ежедневно протоколы допросов подозреваемых, дал санкцию на их арест.
На одной из встреч с новым министром ГБ Игнатьевым Сталин заявил, что если он «не вскроет террористов, американских агентов среди евреев», то будет арестован, как его предшественник Абакумов.
— Мы вас разгоним, как баранов, — заявил вождь.
В октябре 1952 года Сталин дал указания применять к арестованным врачам меры физического воздействия — то есть использовать пытки.
1 декабря 1952 года хозяин Кремля на заседании Президиума (потом этот орган стал называться Политбюро ЦК ВКП(б) — КПСС) разразился критикой в адрес своих соратников:
— Вы слепцы, котята, что же будет без меня? Погибнет страна, потому что вы не можете распознать врагов!»