Каждую неделю с личным составом проводились политзанятия. На них в тесной связи с исторической обстановкой и современностью разбирались актуальные вопросы жизни советского народа и Красной Армии.
В учебно-летном плане партийная ячейка ставила себе главной задачей приблизить обучение и воспитание курсантов к боевым условиям, устранить разрыв между школой и жизнью, характерный для старых учебных заведений. В результате из школы выходили пилоты, способные решать сложные задачи воздушного боя. Обучались они от четырех месяцев до года — в зависимости от индивидуальных качеств — и прямо с учебных аэродромов уходили на фронт.
В борьбе с плавсредствами противника на Азово-Черноморсксм и Каспийском бассейнах, на Волге и Каме красморлеты проявляли много находчивости и храбрости. Боевая пара в то время была редкостью. Вылетая на задание в одиночку, красморлеты смело вступали в бой в открытом море с кораблями противника. И нередко своей дерзостью они заставляли умолкать корабельную артиллерию белых. В Черноморско-Азовском бассейне в борьбе с врангелевскими транспортами особенно отличился 1-й дивизион, которым командовал один из бывших комиссаров школы Г. Д. Кочедыков.
На Волге и Каме воспитанники морской школы С. Г. Козлов и С. Э. Столярский на летающих лодках «М-9» ходили разведывать сухопутные коммуникации врага. В ходе боевых вылетов они обстреливали суда противника из пулеметов и бомбили металлическими стрелами, которые пробивали тонкие палубы и поражали вражеских солдат, притаившихся в трюмах.
Когда же появились на фронтах английские истребители «ДН-4», красморлеты вынуждены были летать на бомбометание ночью на самолетах, не приспособленных для такой работы. Но они не взирали на такие трудности. Успешно решали все боевые задачи, не допуская никаких аварий.
За мужество и отвагу, проявленные в годы гражданской войны, многие воспитанники школы награждались ценными подарками. А такие выдающиеся летчики, как С. Г. Козлов и А. И. Томашевский, удостоились высшей тогда награды — ордена Красного Знамени.
После победного завершения гражданской войны Коммунистическая партия и Советское правительство провели ряд мер по перестройке и укреплению Вооруженных Сил страны. Эти изменения коснулись и Военно-Воздушных Сил.
Страна начинала жить мирной жизнью, и на стрежень великой русской реки вышли пароходы и баржи с грузами для народного хозяйства. К тому же в зимнее время Волга покрывалась льдом. Все это затрудняло планирование летной работы, затягивало сроки подготовки учлетов.
В марте 1922 года морская школа, на основании приказа Главного Управления Воздушного Флота, перебазируется из Самары в Севастополь.