Вскоре после разгрома Московского отделения «Союза защиты» были предприняты меры к ликвидации его казанской организации. В Казань по адресам и явкам, добытым на следствии, выехало несколько чекистов. Под видом офицеров-белогвардейцев они проникли в организацию и собрали необходимые сведения о ней. Во второй половине июня участники «Союза защиты» в Казани были арестованы.
Позднее ВЧК ликвидировала ряд белогвардейско-эсеровских вербовочных центров. 30 июня чекисты задержали на Ярославском вокзале в Москве большую группу офицеров, отправлявшихся в белую армию. Следствие показало, что вербовка добровольцев проходила при активном содействии французской миссии. Каждому добровольцу выдавалось по 400 рублей и документы, удостоверяющие его принадлежность к французской армии. Из Москвы завербованные ехали в Вологду, а оттуда их тайно переправляли в Поволжье к белочехословакам. Вербовочные пункты были раскрыты также в Саратове, Новгороде, Вологде и других городах.
В начале августа ВЧК раскрыла белогвардейскую подпольную организацию «Союз возрождения России». Был арестован один из руководителей организации бывший полковник М. А. Куроченко, который выдал многочисленных ее участников, а также пароли, явки и т. д.
В конце августа 1918 г. ВЧК раскрыла антисоветский заговор дипломатов и сотрудников разведывательных служб Англии, Франции, США и других государств, которым руководил Р. Локкарт. Сведения о существовании заговорщических групп, связанных с разведками иностранных государств, ВЧК получила еще в мае 1918 г. Ф. Э. Дзержинский поручил двум молодым сотрудникам Оперативного отдела ВЧК Я. Буйкису и П. Спрогису поехать в Петроград и проникнуть в одну из таких групп. Чекисты вступили в контакт с некоторыми руководителями организации, связанной с английским военно-морским атташе Кроми. Постепенно Буйкис и Спрогис, выдававшие себя за представителей московского антисоветского подполья, вошли в доверие к контрреволюционерам, и в июле были представлены Кроми как «люди, на которых можно положиться». Кроми познакомил их с С. Рейли. Вскоре Буйкис и Спрогис были направлены заговорщиками в Москву, где их представили Локкарту. Так чекисты оказались в самом центре заговора.
Локкарт поручил Буйкису познакомить его с командиром какой-либо латышской части, охранявшей Кремль. По предложению Дзержинского была организована встреча Локкарта и других руководителей заговора с Э. П. Берзиным — командиром артиллерийского дивизиона, охранявшего Кремль. Берзин был представлен Локкарту как убежденный националист, враг Советской власти. Заговорщики вручили ему 1 млн 200 тысяч рублей для подкупа латышских частей. Полученные деньги Берзин передал в ВЧК.