Войска Суворова были отправлены в Швейцарию. Вместе с уже действовавшими там русским и австрийским корпусами он собирался разбить там французские войска, а затем вторгнуться во Францию. Но французы успели разбить русский корпус Александра Римского-Корсакова и австрийский корпус Фридриха фон Готце еще до того, как войска Суворова могли начать с ними взаимодействовать. Суворов оказался в сложном положении перед превосходящими силами неприятеля, но смог с честью из него выйти и вернуться в Австрию, хотя и потерял около трети армии. В октябре 1799 года он был произведен в генералиссимусы российских сухопутных войск. Вскоре Павел разорвал союз с Австрией и приказал армии Суворова вернуться в Россию. В дороге Суворов заболел. Когда выяснилось, что в Итальянском и Швейцарском походах Суворов держал при себе дежурного генерала, что полагалось иметь только монарху, Павел разгневался на полководца. Когда Суворов прибыл в Петербург, император отказался его принять. Вскоре, 6 (18) мая 1800 года, Александр Васильевич скончался и был похоронен в нижней Благовещенской церкви Александро-Невской лавры.
Король Франции Людовик XVIII, лично знавший Суворова еще будучи графом Прованским и графом де Лилле, в период эмиграции, так характеризовал его: «Этот полудикий герой соединял в себе с весьма невзрачной наружностью такие причуды, которые можно было бы счесть за выходки помешательства, если бы они не исходили из расчётов ума тонкого и дальновидного. То был человек маленького роста, тощий, тщедушный, дурно сложенный, с обезьяньею физиономией, с живыми, лукавыми глазками и ухватками до того странными и уморительно-забавными, что нельзя было видеть его без смеха или сожаления; но под этою оригинальною оболочкой таились дарования великого военного гения. Суворов умел заставить солдат боготворить себя и бояться. Он был меч России, бич турок и гроза поляков. Жестокий порывами, бесстрашный по натуре, он мог невозмутимо-спокойно видеть потоки крови, пожарища разгромленных городов, запустение истреблённых нив. Это была копия Аттилы, с его суеверием, верою в колдовство, в предвещания, в таинственное влияние светил. Словом, Суворов имел в себе все слабости народа и высокие качества героев».
Российский историк Александр Петрушевский со ссылкой на Московский архив Главного штаба писал: «Есть также известие, что Суворов посещал прусские масонские ложи», но полагал, что полководец делал это из чистой любознательности. Однако посещение заседаний масонской ложи человеком, не являющемся масоном, исключено. Французский историк масонства Татьяна Бакунина в книге «Знаменитые русские масоны» (1935) сообщает со слов «лица, имевшего доступ в архив ложи «Три глобуса» в Берлине», что в списке членов кёнигсбергской ложи «Zu den Drei Kronen» («К трём коронам»), представленных 16 (27) марта 1761 года в ложу «Три глобуса», под № 6 значится «Oberleutnant Alexander von Suworow» (здесь явно неправильное прочтение, в оригинале должно быть: «Oberstleutnant Alexander von Suworow», так как Суворов в то время был подполковником и действительно приезжал в Кёнигсберг навестить своего отца, назначенного генерал-губернатором Восточной Пруссии). Согласно Бакуниной, Суворов был посвящён и возведён в третью степень – мастера – в Петербурге в ложе «Aux Trois Etoiles» («Три звезды»), а 27 января (7 февраля) 1761 года был произведён в шотландские мастера в ложе «Zu den drei Kronen» («К трём коронам») в Кёнигсберге (где он навещал своего отца) и числился членом этой ложи до отъезда из Кёнигсберга в начале 1762 года. Российский историк Андрей Иванович Серков на основании сохранившихся протоколов ложи «Zu den drei Kronen» («К трем коронам») в Кёнигсберге отмечает, что Суворов с 25 января 1761 года посещал кёнигсбергскую ложу как «брат петербургской ложи «Три звезды» и не только был активным членом – посетителем ложи, но и сам рекомендовал для вступления в её ряды не менее 5 человек, а в другой кёнигсбергской ложе, Святого Андрея, созданной уже во время русской оккупации (в ней были введены две степени масонства «французского», доминировавшего в России), – не менее 6 человек. О связях Суворова с российскими масонскими ложами после 1762 года данными историки пока не располагают.