Пемза представляет собой особую вулканическую породу, чрезвычайно легкую и пористую; она образуется в результате быстрого проникновения в ее поры газов, когда пемза еще не затвердела. Во время извержения пемза и вулканический пепел были выброшены на огромною высоту и покрыли большой участок моря на значительном расстоянии от вулкана. Должно быть, большое количество пемзы, плававшей толстым слоем по волнам, сильно затруднило судоходство в Эгейском море, особенно в южной его части. Это подтверждают различные источники. Профессор Маринатос обнаружил толстый слой пемзы в Амнизосе, в порту минойокого Кносса на Крите. Вулканический пепел, скорее всего из вулкана Стронгиле, был найден на дне моря к югу от Крита в 1947/48 году в кернах, отобранных учеными шведского экспедиционного судна «Альбатрос». Профессор Макс Пфанненштайль обнаружил принесенную волнами пемзу и кернах, взятых на послеледниковой террасе на высоте пяти метров над уровнем моря к северу от Яффы — Тель-Авива. По мнению Пфанненштайля, этот слой был образован после извержения на Санторине.
Когда вулкан взорвался и выбросил огромную массу пород, море устремилось в образовавшееся пустое пространство. Достигнув дна полости, вода мгновенно ринулась вспять. Быстрое перемещение огромных масс морской воды породило волны невероятной высоты. Эти волны затопили берега Восточного Средиземноморья, полностью разрушив все города и селения по всему Эгейскому побережью.
По словам профессора Р. У. Хатчинсона, из крупных поселений на равнинах Крита только Палекастро и Закрос, расположенные восточнее всех, «по-видимому, избежали пагубных последствий наводнений и землетрясений», скорее всего вызванных взрывом центральной части Стронгиле. Правда, позднейшие раскопки показали что и эти два поселения сильно пострадали от той катастрофы. А главное — археологические свидетельства подтверждают, что практически всему Криту был нанесен чудовищный урон, и это дает нам ключ к разгадкам гибели минойской культуры в XV столетии до нашей эры.
Приблизительное представление о разрушительной силе гигантских волн, вызванных обвалом центральной части Стронгиле, можно составить, вычислив их высоту. Амплитуда цунами прямо пропорциональна их первоначальной амплитуде и обратно пропорциональна квадратному корню из расстояния, пройденного волнами. Кроме того, помимо уменьшения их амплитуды в процессе распространения волн, часть их энергии гасится за счет трения. Если учесть эвстатический подъем уровня моря за последние 3500 лет примерно на 6–9 футов, высота морских волн, докатившихся до Яффы — Тель-Авива, должна была достигать по крайней мере 22 футов. Таким образом, если волны, вызванные взрывом Стронгиле, достигали 7 метров, когда они докатились до Яффы — Тель-Авива, то есть за 562 мили от вулкана, нетрудно подсчитать, что в центре катастрофы они должны были вздыматься по крайней мере на 690 футов. Этот подсчет первоначальной высоты цунами полностью соответствует последним выкладкам профессора Маринатоса.