Последствия этого извержения ощущались в течение трех месяцев. Ядовитые газы вблизи побережья отравили 40 крестьян и большое количество скота, вся равнина была покрыта телами мертвых птиц и других животных. Многие жители потеряли зрение на 6–9 дней. От сероводородных испарений потемнели серебряные и золотые монеты и другие металлические предметы, даже те, которые хранились в закрытых ларцах. Недалеко от Колумбоса парусное судно застряло в плавающей пемзе, и всю его команду, девять человек, постигла трагическая смерть. Слой пемзы на море был таким толстым, что брошенные на него камни не тонули, и многие считали, что он мог бы выдержать даже человека, если бы кто-нибудь попытался пройти или проползти по нему. Пемзы было так много, что она покрыла все море между Кикладами. Но через некоторое время после извержения вулканический остров снова погрузился в море, и сейчас его коническая вершина находится на глубине 10 фатомов от поверхности моря.
Однако, для того чтобы по-настоящему оценить трагические последствия чудовищного извержения Стронгиле-Санторина в XV столетии до нашей эры, его необходимо сравнить с извержением вулкана Кракатау, самим мощным из зарегистрированных в исторические времена (оно произошло 27 августа 1883 года), тем более что немецкий вулканолог Г. Рек утверждает, что корытообразная вулканическая кальдера Санторина образовалась точно таким же образом, как вулканическая впадина Кракатау в Зондском проливе, между Суматрой и Явой.
До этого извержения Кракатау спал 203 года. Началось оно 20 мая 1883 года, однако взрывная активность была незначительной и достигла апогея лишь 27 августа. В тот день после серии страшных взрывов три четверти острова, достигавшего площади 21 квадратной мили, обрушилось в море, и на этом месте образовалась гигантская впадина глубиной от 110 до 160 фатомов. Воды Индийского океана устремились в этот провал. Внезапное перемещение огромных масс воды вызвало три огромные волны. В Аньере, на Яве, они достигли высоты 118 футов, а в Телукбетунге, на Суматре, — 131 фута. В Телукбетунге датский военный корабль выкинуло на сушу, и он застрял в миле от берега на высоте 30 футов над уровнем моря. Аньер и еще двадцать девять других городов на британских побережьях Явы и Суматры были частично или полностью разрушены, 36 тысяч человек погибли при катастрофе или утонули. Воздушная волна, вызванная извержением Кракатау, поднял на море такое волнение, что сорвала с якорей корабли, стоявшие на рейде Вальпараисо, в Чили. Подсчитано, что «подобный волновой воздушный удар мог бы вызвать только взрыв бомбы мощностью не менее 100–150 мегатонн».