В 1939–1940 годах на воссоединенные территории была передислоцирована основная часть советских войск, располагавшихся на Западе. В условиях назревания военной угрозы предпринимались меры по укреплению западных границ. Строились новые и реконструировались старые аэродромы, создавались склады горючего и боеприпасов. Проводились мероприятия по материально-техническому оснащению войск приграничных округов, пополнению их личным составом за счет дополнительного призыва контингентов из запаса и выдвижению соединений и частей из глубины страны в западные районы.
Вместе с тем войска западных приграничных округов испытывали большие трудности, связанные с подготовкой театра военных действий. Многие объекты инфраструктуры приходилось строить и оборудовать заново. Основные инженерные сооружения в укрепленных районах (УPax) и оборонительных полосах, базы и пункты снабжения, аэродромы, дорожная сеть, узлы и линии связи создавались на территориях западных районов Литвы, Белоруссии, Украины и Молдавии, недавно вошедших в состав Советского Союза. Огромный объем работ требовал больших затрат сил, средств и времени.
Значительная часть людских ресурсов планировалась к поступлению из глубины страны. Это требовало значительного объема межокружных перевозок и привлечения большого количества транспортных средств, которых было недостаточно. После изъятия из народного хозяйства максимально допустимого количества тракторов и автомобилей насыщение ими армии все равно не соответствовало установленным нормам[1792]. Мобилизационное развертывание войск не обеспечивалось и по целому ряду других материальных средств.
В апреле – июне 1941 года, с нарастанием угрозы войны, были приняты дополнительные срочные меры по подготовке ТВД, включавшие в том числе: издание директивы начальника Генштаба от 14 апреля о срочном приведении в боеготовность всех долговременных огневых сооружений, укрепленных районов с установкой в них оружия полевых войск при отсутствии табельного; создание с апреля 1941 года командных пунктов и занятие их 18–21 июня срочно сформированными фронтовыми управлениями; приказ НКО № 0367 от 27 декабря 1940 года и его повторение 19 июня 1941 года о рассредоточении и маскировке самолетов; направление 14 июня 1941 года Сталиным генерала К. А. Мерецкова в западные приграничные округа для проверки боеготовности ВВС.
Управление войсками и связь. Созданная перед войной система стратегического руководства Вооруженными силами в целом обеспечивала строительство армии и флота и управление ими в мирное время, но не отвечала требованиям военного времени. Система командных пунктов и стратегической связи была развита слабо. Нарком обороны, Генштаб, начальники видов и родов войск командными пунктами не располагали.