После войны Н. Г. Кравченко служил в ГСВГ — заместителем начальника военной контрразведки МГБ СССР, заместителем начальника Особого отдела МВД по Белорусскому военному округу, а затем начальником Особого отдела КГБ по Прикарпатскому ВО. В 1959 году он был уволен по указанию Н. С. Хрущева, якобы за нарушение «социалистической законности».
На самом деле он в тридцатые годы участвовал в качестве помощника следователя при допросах разоблаченных агентов польской резидентуры «ПОВ» (Польской организации войсковой). Он, будучи молодым оперативником, всего лишь в качестве писаря заполнял графы протокола.
В ходе детальной проверки материалов обвинения в его адрес, они не подтвердились. А наш герой пострадал — его отправили на 50 % пенсии, т. е. лишили генеральской пенсии, отобрали квартиру во Львове и унизили запрещением носить военную форму.
Он уехал к сестре в Калининград, где когда-то руководил армейским аппаратом Смерш Особого военного округа Кенигсберг (1945–1946). Генерал-фронтовик мужественно, достойно великому гражданину Отчизны перенес эти издевательства властей.
Без коллектива жить не мог, устроившись на общественных началах помогать местному Парткому. Много читал. От него ждали и коллеги, и простые граждане откровений об операциях против немецких спецслужб в Тегеране. Но он молчал. Видно, соблюдал оперативный обет.
Охотно делился впечатлениями о начале войны, когда он служил в Одесском особом ВО. Рассказывал об участии в тяжелых и вязких боях и оперативных операциях на многочисленных фронтах.
Скончался Н. Г. Кравченко 13 апреля 1977 года.
Автору довелось служить ровно через десять лет после ухода Н. Г. Кравченко на пенсию в Особом отделе КГБ по ПрикВО. Тогда работало еще много офицеров, которые знали его до увольнения.
Прошло время и автор, благодаря воспоминаниям военных контрразведчиков Советов ветеранов ДВКР, ФСБ РФ (Ф. И. Рыбинцева, В. Г. Иванова, В. Б. Коковина, Д. Ф. Капранова, Г. М. Казимира и др.), а также Управления ФСБ по Калининградской области (С. И. Захарова) собрал материал и подготовил две документально-художественных книги в Издательском Доме «Аргументы недели» о забытом герое генерал-майоре Н. Г. Кравченко: «Смерш в Тегеране» и «Он спас Сталина».
После выхода в свет книг появились публикации о нем в СМИ, документальные зарисовки на центральном телевидении. В 2012 году в честь 100-летнего юбилея на кладбище состоялся митинг общественности города.
18 декабря 2019 года с участием представителей Калининградского отделения Российского союза ветеранов у дома № 38–40 прошел торжественный митинг, посвященный открытию мемориальной доски генералу Н. Г. Кравченко.