4000-фунтовые бомбы впервые применили в ночь на 4 февраля 1944 г. Пара «Москито» B.IX из 692-й эскадрильи (только что перевооружившейся) в сопровождении шестерки B.IV из 105-й эскадрильи сбросили бомбы на Дюссельдорф. В следующую ночь еще три бомбы были сброшены на Киль. Применение столь мощных боеприпасов по городам имело, в основном, морально-психологическую направленность. Руководители Бомбардировочного командования не без оснований считали, что с точки зрения боевой эффективности гораздо более выгодно сбросить четыре 227-кг бомбы.
В декабре 1943 г. совершили первые боевые вылеты бомбардировщики «Москито» В.ХХ канадской постройки. Их получила на вооружение 139-я эскадрилья. Вряд ли английские летчики обрадовались этому событию: их коллеги из 692-й эскадрильи уже готовились принять новейшие В.XVI, В.ХХ – это лишь заокеанская копия В.IV. Почти все «Москито» В.XVI прямо с завода выходили с увеличенными бомбоотсеками для подвески 4000-фунтовой бомбы «Куки» (ее конфигурация напоминала цилиндрическую упаковку американского печенья, называемого в Англии «cookie»). Первый боевой вылет В.XVI под управлением флайт-лейтенанта Моора состоялся 5 марта 1944 г., целью этого налета был Дуйсбург.
К концу месяца 692-я эскадрилья располагала уже шестью такими машинами. Все новые и новые подразделения перевооружались на «Москито»-бомбардировщики: в апреле к боевым вылетам приступила 571-я, в августе – 608-я, в сентябре – 128-я, в октябре – 142-я эскадрильи. Вице-маршал авиации Беннет выразил надежду, что вскоре Великобритания будет располагать воздушным флотом из двухсот «Москито» В.XVI.
На момент высадки союзных войск на европейский континент в боевых подразделениях Бомбардировочного командования имелось всего 58 исправных «Москито», которые 6 июля 1944 г. приняли участие в ударе по железнодорожному узлу Оснабрюк. В последующие дни основные усилия бомбардировочных эскадрилий были сосредоточены на нефтеперерабатывающих предприятиях и заводах синтетического горючего. Иногда «Москито» привлекались к минированию акваторий с воздуха. Так, утром 13 мая тройка В.XVI и десятка В.IV из 692-й эскадрильи с малой высоты перегородили минами Кильский канал, тем самым на неделю прекратив судоходство в канале. На входах в канал скопилось более семидесяти судов. Были фактически сорваны снабжение немецкой группировки в Норвегии и доставка легирующих материалов из Швеции.
С появлением мощных бортовых радиолокаторов эскадрильи «Москито» стали разнообразить тактику ударов. В ночь на 26 июня 1944 г. «Москито» отбомбились с высоты всего 1500 м. Правда, не все шло гладко: аппаратура H2S на лидирующем самолете отказала, поэтому цель – город Геттинген – 35 экипажам пришлось отыскивать самостоятельно. Но еще больший конфуз произошел спустя трое суток. В ту ночь радиолокаторы вышли из строя на всех шести (!) «Москито»-лидерах из 139-й эскадрильи. Такова была надежность техники. Случались и другие «чудеса». Тяжело груженные «Москито» (особенно с 1816-кг бомбой) имели значительную длину разбега. Темной, непроглядной ночью выдержать направление взлета удавалась не всегда.