Чтобы как-то восполнить отсутствие надводных кораблей и повысить эффективность блокады, пришлось держать в Угольном районе одновременно две лодки, что поставило вопрос об организации взаимодействия между ними.
В июне-июле подводные лодки 6 раз выходили к побережью Турции: “Нерпа” в период с 10 по 20 июня и с 2 по 8 июля, “Тюлень” с 21 по 27 июня и с 22 июля по 1 августа, “Морж” с 4 по 13 июля, “Кит” с 21 июня по 1 июля.
Общие результаты боевой деятельности лодок в июне-июле 1916 г.: 2 потопленных парохода, 3 буксира и 4 парусника. При этом 6 июля “Морж” наблюдал вход в Босфор крейсера “Гебен”, но не смог атаковать его из-за слишком большой дистанции.
Во второй половине 1916 г. лодки совершили 19 походов продолжительностью от 5 до 12 суток. Сохранять непрерывность несения боевой службы у берегов Турции не удавалось. Смена лодок происходила в Севастополе, и в лучшем случае выход на боевую службу очередной лодки происходил в день прихода предыдущей. По-прежнему дальность радиосвязи между лодками оставалась недостаточной, только при установке новых радиостанций она приближалась к 300 милям.
18-28 августа “Нерпа” действовала в восточной части Босфорского района и 21 августа была атакована немецкой лодкой “UB-7”, но торпеда прошла под очень острым углом к корпусу и не взорвалась.
Наиболее примечательным событием во второй половине 1916 г. был бой подводной лодки “Тюлень”, которой командовал старший лейтенант Китицын, с турецким пароходом “Родосто” водоизмещением 6000 т. “Родосто” был вооружен 88-мм орудиями, которые обслуживали офицеры и матросы с немецкого крейсера “Бреслау”. Обнаружив 11 октября “Родосто”, Китицын занял позицию между берегом и пароходом, отрезав его отход под защиту береговой артиллерии. При полной луне и ясной штилевой погоде “Тюлень” был не виден на фоне темного берега. В 12 ч 40 мин, когда дистанция до “Родосто” достигла 8 кабельтовых, командир приказал открыть огонь из 76-мм орудия. Завязалась артиллерийская дуэль, продолжавшаяся около часа, на “Родосто” возник пожар. Турецкая часть команды покинула судно. “Тюлень” сблизился с “Родосто” на 4 кабельтова и выпустил по нему последние 7 снарядов прямой наводкой. Пароход стал парить, уменьшил ход, пожар усилился, артиллерийский огонь прекратился. На борт “Родосто” была высажена призовая команда, которая сумела локализовать пожар, подняла пары и исправила рулевое управление. Тем временем команда “Тюленя” выловила из воды немца-капитана и поставила его за машинный телеграф “Родосто”. Пароход в сопровождении “Нерпы” двинулся в направлении Крыма. Через 40 ч плавания они пришли в Севастополь, за это время пожар на судне окончательно ликвидировали.