Второй пункт, где проявился талант Энгельса как ученого-энциклопедиста, касался большой проблемы, известной под названием классификации наук. Эту проблему Энгельс решал двояко: и в более широком, общем плане, охватывая все теоретические науки, и в более узком, частном плане, занимаясь детальной классификацией естественных наук, включая сюда и математику. О втором плане мы скажем ниже. Сейчас же остановимся на общем плане, охватывающем все науки. Уже из самого определения диалектики, как учения о наиболее общих законах развития природы, общества и мышления, следует, что вся предметная действительность, весь мир – материальный и духовный – подразделяется Энгельсом на три основные области: природу, общество и мышление. Соответственно этому все фундаментальные (как теперь говорят) науки также могут быть подразделены на три большие группы: естественные науки, изучающие природу и ее законы, социально-экономические (исторические) науки, изучающие общество и его законы, и философские науки, в том числе логика, изучающие мышление человека. В эти последние входит и сама диалектика. Тем самым философия охватывает собой не только одну из трех областей предметного мира (мышление), но и все три его области с точки зрения тех законов, которые присущи не отдельным его областям, а всем трем одновременно. Это означает, что философия касается природы, общества и мышления, но только со стороны того общего, что их объединяет все вместе.
В итоге получается основной скелет общей системы всех наук, которые не просто сополагаются одна рядом с другой, а взаимосвязываются и взаимодействуют между собой, проникая друг друга, образуя при этом многочисленные промежуточные, комплексные и стыковые области знания. Поэтому графически, как нам кажется, систему наук, основанную на определении диалектики, данном Энгельсом, можно представить в виде треугольника (хотя сам Энгельс такой схемой не пользовался); вершины его представлены тремя упомянутыми уже группами наук (естественных, общественных и философских), причем диалектика, как основная часть философии, охватывает все три вершины треугольника. Стороны же этого треугольника выражают взаимные связи между отдельными группами наук, например, между естествознанием и социально-экономическими науками, куда нужно отнести все технические или практические науки в широком смысле слова (включая сельскохозяйственные и медицинские). Точно так же математические науки становятся на грани между естествознанием и философией (логикой). В отношении же многих, особенно позднее возникших, наук вопрос о их месте в этой системе должен решаться путем выяснения всех их связей, по крайней мере самых важных и определяющих, с другими науками. Возможны такие сложные случаи, когда данная наука оказывается связанной со всеми тремя главными группами наук одновременно, как это мы видим, например, в случае психологии. Иногда же связи науки еще более сложны и разветвлены, как это наблюдается у кибернетики.