19 марта 1940 г. капитана «Куин Мэри» Р.Б. Ирвинга вызвали в манхэттенский офис «Кунард Уайт Стар Лайн», где его проинформировали о том, что в течение 48 часов судно должно быть готово к выходу в море. Конечным пунктом вояжа был назначен Сидней, промежуточными пунктами — Тринидад, Кейптаун и Фримантл. Недостающих членов экипажа предписывалось взять со старого кунардовского лайнера «Антония», стоявшего у соседнего пирса. В тот вечер судно ожило: были проведены шлюпочные учения, по палубе сновали портовые рабочие и члены экипажа, пирс охранялся усиленными патрулями.
20 марта разнотолки по поводу оживления на борту «Королевы» были подогреты исчезновением из порта кунардовского лайнера «Мавритания II», который под покровом ночи, тумана и дождя был выведен буксирами на речной фарватер и ушел в море. «Мавритания II» также предназначалась к конверсии в войсковой транспорт в Сиднее. Сотрудники Интеллидженс Сервис питали надежду на то, что германская резидентура в Нью-Йорке сочтет рост активности на «Куин Мэри» лишь ширмой, призванной отвлечь внимание от исчезновения «Мавритании II». В этом случае, как надеялись Джеймсы Бонды, внимание германских боевых кораблей и подводных лодок, которые, возможно, патрулировали подходы к Нью-Йорку, будет привлечено к меньшему по размерам и менее ценному лайнеру, что снизит вероятность встречи «Королевы» с врагом.
21 марта, в начале девятого утра, портовые буксиры вывели «Куин Мэри» на фарватер и развернули ее вниз по течению реки. Под эскортом полицейских катеров и небольших судов береговой охраны США лайнер на малом ходу вышел в океан. После этого «Королева» развила полный ход и вскоре скрылась из виду.
37 дней спустя «Королева» прибыла в Сидней, преодолев более 14000 морских миль с тремя дозаправками. Среднерейсовая скорость составила 27,2 узла. 18 апреля лайнер отшвартовался у пирса инженерной компании «Кокату», где немедленно под бдительным присмотром инженеров «Кунарда», прибывших из Лондона, началось его переоборудование в войсковой транспорт.
Кунардовская «Мавритания II» была выбрана в качестве «жертвенной пешки», чтобы обезопасить «Куин Мэри» при первом военном выходе в Атлантику
Задача оказалась не из легких. Остатки внутреннего убранства лайнера вместе с более чем двумя тысячами каютных дверей были демонтированы и сложены на местных складах. Во всех пригодных для размещения личного состава помещениях появились деревянные нары и брезентовые гамаки. Расположенные в гранд-холле судна магазины были переоборудованы под военные офисы. Для защиты наиболее уязвимых частей надстройки использовали старые проверенные методы: на окнах ходовой рубки поставили жалюзи, огневые позиции артиллеристов и дымоходы обложили мешками с песком.