После захвата армянскими войсками Губадлы азербайджанские войска, отойдя из Губадлы, заняли оборону по границе Губадлинского и Зангеланского районов. 4 сентября 1993 г., при посредничестве министра обороны России Павла Грачева, было заключено соглашение о прекращении огня. Фронт на момент заключения перемирия проходил по следующей линии: граница Зангеланского района с Арменией, далее по границе Зангеланского и Губаддинского районов, затем в Джебраильском районе по линии сел Черели – Ханлыг – Тинли – Шавелли и далее вдоль дороги Горадиз – Зангелан до села Куйджак, далее по линии Горадиз – Ашагы Абруахманлы – Ашагы Сеидахмедли – Алаханлы, западнее границы Агджабединского и Ходжавендского районов, по линии сел Афатли – Зангишалы – Чеменли – Джавахирли – Гюллюджа – Шотланлы – Кармираван – Левонарх – Мадагиз – Гюлистан и по Муровдагскому хребту.
Перемирие (заключенное до 5 ноября 1993 г.) продлилось до 21 октября 1993 г., когда армянские войска перешли в наступление на юго-западном участке фронта. 23 октября армянские войска начали штурм Горадиза. Заняв этот важный транспортный узел, армянские войска отрезали Зангиланский и ранее неоккупированную часть Джебраильского и Зангеланского районов от остальной территории Азербайджана. 28 октября 1993 г. армянские войска заняли райцентр Зангелана, а утром 1 ноября – железнодорожную станцию Миндживан и прилегающие населенные пункты. Личный состав Зангиланского полка отошел в Иран, переправившись вместе с боевой техникой и вооружением через реку Араке. За десять месяцев 1993 г. Азербайджан, пребывавший в состоянии перманентного внутриполитического кризиса, начавшегося с заявления НФА от 9 февраля 1993 г., утратил в результате наступления противника контроль над территорией шести районов. Боевые действия переместились за пределы нагорной части Карабаха. К началу ноября фронт стабилизировался по линии: Муровдагский хребет – Гюлистан – Мадагиз – Левонарх – Правобережный тертерский канал – Гюллюджа – Джавахирли – Чеменли – Афатли – западнее границы Агдажбединского и Ходжавендского районов – граница Бейлаганского и Физулинского районов.
Наступательная операция на Южном участке фронта
После захвата армянскими войсками Зангеланского района и пос. Горадиз руководство Азербайджана во главе с Гейдаром Алиевым было полно решимости взять военный реванш. Со свойственной ему решимостью и целеустремленностью Гейдар Алиев взялся за дело. С целью укрепления армии было обеспечено функционирование централизованной системы командования и управления; на постоянной основе введена современная организационная структура подразделений, частей и соединений; существенно улучшились службы тыла и снабжения. Были проведены перестановки в высшем военном командовании. 2 ноября 1993 г. полковник Сафар Абиев был снят с должности начальника генерального штаба. На должность начальника генерального штаба был назначен генерал-майор Наджмеддин Садыхов. Начальником оперативного управления генерального штаба был назначен генерал-майор Александр Васяк.