1666 г. “Мор” вновь опустошил Старую Руссу. В этот год произошло серьезнейшее событие, которое невольно отразилось на жизни Старой Руссы. Уже на второй год патриаршества Никон начал церковную реформу, что вызвало раскол не только среди духовенства, но и мирян. И в том, что старообрядчество, наверное, как нигде сохранилось в южном Приильменье, далеко не последнюю роль сыграли весьма непопулярные действия Иверского монастыря.
В дальнейшем Никон пытался противопоставить власть патриарха власти царя, что привело в 1658 г. к их полному разрыву и реформатор уехал в основанный им в Подмосковье Новоиерусалимский Воскресный монастырь. Не дождавшись в течение нескольких лет призыва к возвращению, он попытался самовольно приехать и занять прежнее место. Но был выслан обратно, а церковный собор 1666 г., подтвердив проведенные реформы, лишил его высокого сана.
С низвержением Никона влияние Иверского монастыря в Старой Руссе, естественно, резко ослабло. Пришлось менять тактику: частыми стали подкупы верхушки посада “в почесть солью и деньгами”. В праздники устраивались пиршества, особенно за городом в приписном Кречевском монастыре. У своих же крестьян закупали дрова в счет будущих поставок, наиболее опытных работников из кабальных и “купленых” уравнивали с вольнонаемными.
1667 г. Наконец-то Приильменье навсегда избавилось от непрошеных гостей. 30 января в д. Андрусове близ Смоленска было подписано перемирие на 13,5 лет, которое послужило основанием для дальнейших внешнеполитических успехов Русского государства. В Польше же, наоборот, начинался упадок, приведший в следующем столетии к поглощению ее соседними Державами.
Уклад городской жизни по-прежнему носил феодальный характер. Русса была богата не только солью, но и льном, пушниной, воском, рыбой, мясом и другими продуктами сельского хозяйства и промыслов. Посевы льна и конопли, их дальнейшая переработка сделались хозяйственной специальностью не только крестьянского, но и посадского населения. Широкое распространение получило домашнее производство холста.
Лен и пеньку везли в Псков, Тихвин, большие партии отправлялись за границу. В писцовых книгах встречаются “скупщики”, скупавшие продукцию у крестьян. Русса играла роль и перевалочного пункта транзитной торговли с Литвой и всей Прибалтикой, через нее проходил скотопрогонный тракт.
1668 г. Не миновала город и линия заграничной почты: Москва — Русса — Новгород — Рига — Берлин.
1670 г. “Бысть в Русской земли зябель по местам, и в тое время быс. хлеб добре дорог в Великом Новгороде”. Привозили “от немец из-за рубежа, иные изо Пскова, и с Москвы”. Голод.