В своем письме Невельской давал Буссе распоряжения на случай войны с Англией и Францией, которая могла разразиться со дня на день. Разрыв с Турцией был первым симптомом к развязыванию войны58.
Невельской приказывал Буссе не оставлять Сахалина, но разбить имеющийся в его распоряжении отряд на группы по 6-8 человек и разместить их по постам в заливах Анива, Такмака, Кусунай, Дуэ и Терпения.
Внутренние пути сообщения по острову, недоступные неприятелю, русским были известны, и снабжение таких полупартизанских партий, способных приковать к себе значительные силы врага, не представляло бы невыполнимой задачи.
В донесении генерал-губернатору Геннадий Иванович обобщал все сведения и весь опыт, накопленный экспедицией. На основании этих данных он предлагал мероприятия как по освоению края, так и по обороне его в грядущей войне.
С Дмитрием Ивановичем Орловым было послано в Императорскую гавань Бошняку распоряжение идти на корабле "Николай I" к пункту 46°30' и отсюда на шлюпке и байдарке начать исследование побережья к югу. Сам Невельской к 5 июня рассчитывал встретиться с Бошняком в условленном месте побережья и оттуда отправиться на "Байкале" в наиболее удобную из южных бухт, чтобы занять ее военным постом.
Геннадий Иванович снова настойчиво подчеркивал идею о единственно важном значении для России незамерзающих бухт в Уссурийском крае, удобно сообщающихся по рекам Уссури и Амуру с внутренними областями государства.
Муравьев считал, что достаточно ограничиться левым берегом Амура, чтобы в устье его создать перевалочный пункт грузов, предназначенных для развития и укрепления Петропавловска. Занятие Де-Кастри и Императорской гавани казалось ему излишним.
Но Невельской в своем донесении писал о необходимости поставить пост в устье Уссури: "Пункт этот, как ближайший к побережью южного Уссурийского края и как пункт центральный относительно Нижнеамурского и Уссурийского бассейнов, представляет такую местность, в которой должна сосредоточиваться вся главная наша деятельность в этом крае и управление им"59.
Геннадий Иванович указывал на мероприятия, которые, по его мнению, следовало предпринять в первую очередь для исследования Сахалина и упрочения его за Россией, а затем подробно излагал план обороны края на случай войны.
Русская эскадра на Тихом океане была так незначительна, что не могла противостоять силам англо-французов в открытом сражении. Кроме того, она все еще не имела баз для снабжения и ремонта. Но, с другой стороны, неприятель ничего не знал об открытиях Невельского. Освоенные им прибрежья были врагу совершенно неведомы Гиль и Остен не сумели открыть тайну Амура. План Невельского заключался в том, чтобы, избегая решительных сражений, привлечь неприятеля к блокаде побережья до корейской границы и тем самым заставить его фактически признать край принадлежащим России, отвлекая вместе с тем значительные силы врага на эту блокаду.