Это была одна из целой серии экспедиций, задуманных для разрешения двух кардинальных вопросов: 1) вопрос пограничный (о пределах китайского правительственного влияния и о правах Китая на приамурские земли) и 2) вопрос морской, то есть вопрос о наличии на побережье края, к югу от устья Амура, гаваней, удобных для якорных стоянок флота и морской торговли. Решение этих вопросов требовало тщательных, подробных исследований.
Обширный край, который Нессельроде считал китайским владением, оказался, как и предполагал Невельской, вне сферы официального влияния "Небесной империи". Отдельные маньчжурские купцы, бродившие среди местных племен, на свой страх и риск быстро признали первенство русских в этих местах и не смогли противостоять решительным действиям Невельского.
Геннадию Ивановичу стало ясно также, что официального протеста Китая, которого так страшился Нессельроде, не последует. Это обстоятельство еще более укрепило его намерения действовать шире пределов инструкции.
Но, кроме фактического права, права первенства в официальном занятии края, не принадлежащего народу с организованной государственной властью, Невельской надеялся подкрепить право России на Приамурье ссылкой на один из пунктов Нерчинского договора. Для этого нужно было исследовать направления горных хребтов на северной стороне Амура. Так исчерпывался первый вопрос.
Второй вопрос, морской, требовал также тщательных исследований.
Однако летом 1850 года Невельской не смог развернуть деятельность поисковых экспедиций, так как следовало все силы употребить на окончание строительных работ в Петровском и Николаевске до наступления холодов.
К половине октября матросы закончили две юрты, окружили их засеками и перебрались в них из палаток, где жить становилось невозможно.
В Петровском работы также подходили к концу.
Зима надвигалась. Но и зимою Амурская экспедиция не была полностью отрезана от мира. Связь поддерживалась через Аян, до которого берегом было не менее 1000 километров. Связь, правда, была очень ненадежной. Невельской договорился с гиляками, что дважды в зиму они будут верхом на оленях доставлять почту в Аян и из Аяна. Путешествие в один конец продолжалось 5-6 недель. В ноябре Невельской отправил срочную депешу Муравьеву, в которой сообщал генерал-губернатору, что данные ему повеления не соответствуют обстоятельствам и что он вынужден отступить от них.
Он описывал положение в крае, скудость своих средств и трудности, которые переносят в связи с этим участники экспедиции. Геннадий Иванович просил к весне прислать еще двух офицеров и 50 человек рядовых, но только не из штрафных, а доброго поведения и знающих какие-нибудь мастерства. Необходим был также паровой баркас или катер для исследования фарватеров в Амурском лимане.