53 рыцаря из находившихся на острове перешли на службу к Бонапарту, позднее, во время египетской экспедиции создав особую боевую единицу Мальтийский легион. За неделю пребывания Наполеона на Мальте он по своему обыкновению "достойно" наградил мальтийцев за неоказание сопротивления все титулы на острове были отменены, рыцарские гербы скалывались со зданий, кафедральный собор был ограблен подчистую, одних книг с Мальты было вывезено 972.840 экземпляров. Французам достались 4 фрегата, 3 галеры и 2 грузовых корабля, 1200 пушек, 30.000 ружей, 13.000 бочек пороху и продовольствие на 6 месяцев. "Сокровища, взятые здесь ими, были бесчисленны" [50].
На острове остался двухтысячный французский гарнизон во главе с генералом Вобуа.
Об этом горьком для мальтийцев периоде М. Морошкин писал:
"Между тем умер Роган, Гроссмейстер Ордена; преемником ему избран был барон Гомпеш. 7 членов этого Ордена, бальи Турина Фризари и Мария Теста Феррата, командор Буаредон де Нансуст, доктор Мускати, адвокат Бенедикт Шембр и советник Бонани, при посредстве рыцаря Филиппа Амата, испанского агента при Ордене. 13 июня 1798 г. без ведома Гомпеша* изменнически передали Мальту, главную резиденцию Ордена, Наполеону.
{* Такая версия основывается на письмах самого Гомпеша, направленных императорам Австрии и России, в которых он пытался оправдаться. Расследование сдачи Гомпешем Мальты, несмотря на требования папы, так и не было проведено. Это послужило одним из поводов в отказе легитимности низложения Гомпеша рыцарями Российского Приорства и избрания Павла I Великим Магистром. - Авт.}
Гомпеш скоро должен был оставить Мальту по приказанию французского правительства, и принужден был сначала отправиться в Триест, а потом переехать в Рим и вести здесь уединенную и частную жизнь. Как только весть о сдаче острова достигла до Санкт-Петербурга, тотчас собрались кавалеры и все члены Великого Приорства Российского в своем орденском доме в Санкт-Петербурге, для выражения негодования на малодушный поступок Гомпеша и на предательство других своих сочленов, отдавших остров в руки французов" [57].
* * *
Покидая Мальту, Гомпеш увез с собой святыни Ордена - правую руку Иоанна Крестителя, Филермскую икону Божией Матери, часть Животворящего Креста, Орденские Печать, Корону и "Кинжал верности". Все остальное спасти от разграбления не удалось.
Избрание Павла I Великим Магистром
Захват французами Мальты в 1798 г., потеря почти всего достояния Ордена и его казны, как и позорный акт о капитуляции были вменены в вину Фердинанду фон Гомпешу. Многие рыцари Ордена, принадлежавшие к различным приорствам и "языкам", отправились в поисках убежища во владения своего Протектора - в Россию.