Во время отсутствия начальника Управления его обязанности выполняет один из его заместителей по поручению начальника Управления. Структурными подразделениями Управления являются отделы по основным направлениям деятельности Управления.
Начальник Управления:
1) руководит деятельностью Управления и несет персональную ответственность за осуществление возложенных на Управление полномочий, а также состояние исполнительской дисциплины в Управлении;
2) осуществляет контроль и принимает необходимые меры по соблюдению в Управлении сроков исполнения документов;
3) вносит предложения на рассмотрение руководителя ФАС России, его заместителей, Коллегии ФАС России по вопросам, относящимся к ведению Управления;
4) участвует в установленном порядке в заседаниях коллегии ФАС России, а также в совещаниях, проводимых руководителем ФАС России и его заместителями, при обсуждении на них вопросов, относящихся к ведению Управления;
5) представляет ФАС России по поручению руководителя ФАС России в органах государственной власти и в российских организациях, а также в учреждениях и организациях иностранных государств и международных организациях;
6) распределяет обязанности между своими заместителями, непосредственно руководит их деятельностью, а также устанавливает обязанности сотрудников Управления;
7) утверждает положения об отделах Управления, а также должностные регламенты работников Управления;
8) дает работникам Управления обязательные для исполнения указания и поручения в пределах компетенции Управления;
9) обеспечивает соблюдение работниками Управления трудовой дисциплины, контролирует своевременное и качественное исполнение ими заданий и поручений;
10) обеспечивает проведение мероприятий, связанных с прохождением государственной гражданской службы, в том числе представляет предложения о назначении на должность и об освобождении от должности, о повышении квалификации, поощрении сотрудников Управления и наложении на них взысканий;
11) обеспечивает ведение делопроизводства в Управлении;
12) обеспечивает соблюдение работниками Управления режима секретности при работе с документами, а также организацию работы по защите сведений, составляющих государственную тайну, и информации ограниченного доступа, находящихся в ведении Управления или полученных им от других органов и организаций;
13) при обнаружении нарушения законности в работе структурных подразделений ФАС России и его территориальных органов или их должностных лиц докладывает руководителю ФАС России об этих нарушениях;
14) осуществляет иные права и выполняет другие обязанности в соответствии с законодательством Российской Федерации и поручениями руководителя ФАС России.