В июне 1925 г. Нансен вновь приезжает в Советский Союз, на этот раз в Армению, где по поручению Лиги наций занимается изучением возможностей размещения армянских беженцев, покинувших в свое время из-за жестокой политики геноцида турецкую Армению и проживавших в различных странах мира. Считая Советскую Армению единственной страной, где армянские беженцы смогут обрести свой «национальный дом», Нансен в сотрудничестве с советскими властями разработал план, по которому в течение двух-трех лет предполагалось освоить 33 тысячи десятин целинных земель и поселить на них около 50 тысяч беженцев. Для осуществления этого плана Нансен рассчитывал получить с помощью Лиги наций заем в размере 8 миллионов рублей.
Однако человеколюбивое стремление Нансена помочь многострадальным армянским беженцам обрести свою настоящую родину натолкнулось в Лиге наций на стену холодного равнодушия. План Нансена был похоронен в Лиге наций, и ему снова пришлось прибегнуть к частной благотворительности. До конца своей жизни он не оставлял забот об армянском народе. С помощью собранных средств ему удалось разместить в Советской Армении около 7 тысяч иммигрантов. Свое пребывание в Советском Союзе в 1925 г. Нансен описал в книгах «По Армении» (1927 г.) и «Через Кавказ на Волгу» (1929 г.).
Хотя неудачи Нансена в Лиге наций как с планом помощи голодающим в России, так и с планом помощи армянским беженцам разочаровали его в эффективности этой организации, тем не менее он продолжал верить, что без Лиги наций нет спасения ни для Европы, ни для мира. Эта точка зрения определялась пацифистскими настроениями норвежской буржуазии. Широкая гуманистическая и пацифистская деятельность Нансена в Лиге наций значительно повысила международный авторитет Норвегии, окружив ее ореолом борца за гуманизм и человеческую солидарность.
Нансен никогда не состоял в какой-либо политической партии, но по своим политическим убеждениям он был правым либералом, с годами становившимся все более консервативным. Его правые взгляды характеризовались прежде всего резко отрицательным отношением к норвежской компартии, к рабочему движению. Как сын своего класса, Нансен был преданным защитником буржуазного строя в Норвегии. Считая невозможным решить классовые противоречия путем борьбы, он ратовал за преодоление чувства недоверия между классами путем взаимных жертв, проповедовал примирение классов на основе человеколюбия и терпимости.
Нансен не признавал партийной политики. По его мнению, партийная борьба препятствует объединению народа для решения крупных общенациональных задач. Противоречия между буржуазными партиями он считал несущественными, а партийную раздробленность рассматривал как наиболее опасный фактор для внутренней жизни Норвегии. В связи с этим он выступал за широкое национальное движение, которое могла бы преодолеть всякие классовые и партийные различия и противоречия. Эта позиция Нансена нашла выражение в том, что он явился одним из инициаторов создания в 1925 г. реакционной организации Отечественный союз, ставившей своей главной целью объединение всех «патриотических» сил для создания мощного национального государства, свободного от классовой борьбы и противоречий партийной политики. Прямой и открытой целью Отечественного союза была консолидация сил буржуазии для борьбы против растущего рабочего движения, против коммунизма. Программа Союза требовала роспуска рабочей партии и компартии как организаций, противоречащих конституции.