Вскоре после этого Василий Шуйский умирает и вся власть сосредотачивается в руках его брата Ивана.
В 1539 году Шуйский устраняет митрополита (который после смерти Василия Московского показал себя бездарным политиком, проиграв абсолютно все интриги), ссылая его в монастырь простым монахом. Новым митрополитом избирается Иоасаф.
Однако он оказывается врагом княжеской партии и в 1540 году организует переворот в ходе которого власть достается ссыльному князю Бельскому, опирающемуся на Думу.
Они (митрополит и князь) разрешают вернуться всем ссыльным и выпускают из заточения князя Владимира Андреевича Старицкого, воссоздавая Старицкий удел.
В конце 1542 году сторонники Шуйских (в первую очередь князья Курбские) организуют очередную смену власти. Бельский ссылается в Новгород, где его вскоре убивают. Митрополит низлагается и его место занимает архиепископ Новгородский Макарий. Главой государства стал князь Иван Шуйский, но он вскоре умер. Новое правительство составили князья Андрей и Иван Михайловичи Шуйские и князь Фёдор Иванович Скопин-Шуйский, при главенстве князя Андрея.
Фактически после смерти Елены Глинской Московское государство не проводило ни внешней, ни внутренней политики. Оно даже не могло защитить свои границы (этим занимались муромские войска). Но ни одно соседнее государство не смогло этим воспользоваться. Сигизмунд Первый Литовский был стар и заботился о передачи власти, Сагиб-Гирей Крымский — болен, Сафа-Гирей Казанский сам сидел на престоле только при крымской и ногайской поддержке и был не в состоянии организовать крупных акций, Игорь Седьмой Сестрорецкий был всецело увлечен азиатскими делами.
Тем не менее этот "бардак" имел и ошеломляюще позитивные результаты. В частности непоследовательные и несвязанные действия Ивана Бельского и Андрея Шуйского чуть поставили Сестрорецкое княжество на колени.
Сестрорецкое княжество все еще оставалось государством с крайне малой плотностью населения. Так, превосходя Московское государство по площади на порядок (в 10 раз), по населению оно превосходило его только вдвое (13 миллионов человек против 5–6 миллионов). При этом языческая экономика была более развита и нуждалась в рабочей силе в намного большей степени. Фактически только два "промышленных центра" язычников (собственно Сестрорецк с бассейном Вычегды и нижнее течение Двины — Белоград и Холмогоры) были более-менее обеспечены собственными трудовыми ресурсами. А запад и юг Сестрорецкого княжества (бывшие новгородские земли, Белозерск, Вологда и Устюг) широко использовали рабочих приходивших на заработки с московских земель. После того как митрополитом стал архиепископ новгородский Макарий — давний и последовательный противник язычества, количество христиан осмеливавшихся работать на язычников заметно уменьшилось. Митрополит обрушился на таких "отходников" с серией проповедей и, повлияв на Андрея Шуйского, добился закрытия границы для них. Это было достигнуто путем комплекса мер, в первую очередь налоговых — с вернувшихся с севера людей стали брать повышенные подати.