В первые послевоенные годы произошли значительные изменения как в составе епископата РПЦЗ, так и среди верующих. После перехода в юрисдикцию Московской Патриархии большинства дальневосточных архиереев – митрополита Мелетия, архиепископа Нестора, архиепископа Димитрия и епископа Ювеналия вместе со значительной частью духовенства и паствы – в Китае в ведении Архиерейского Синода РПЦЗ остался только архиепископ Шанхайский Иоанн (Максимович) На Балканах в ведение РПЦ МП вынужденно, по причине установления в Болгарии социалистического строя, перешел архиепископ Серафим (Соболев). Таким образом, в Европе осталось только два архиерея Зарубежной Церкви: митрополит Анастасий и митрополит Серафим (Ляде), который из-за своего немецкого происхождения и официального положения в III Рейхе был обвинен в том, что скомпрометировал Синод в сотрудничестве с гитлеровским режимом.
Митрополит Серафим скончался 14 сентября 1950 г в больнице от травм, нанесенных ему двумя неизвестными лицами.
Оставаться в Югославии после прихода к власти Тито зарубежный Синод не мог Он переместился вначале на короткое время в Карловы Вары, а потом в Мюнхен Фактически состав прежнего Синода распался, но в Мюнхене он был воссоздан в 1946 г вследствие присоединения к РПЦЗ значительной группы архиереев, эмигрировавших из СССР и входивших ранее в состав Автономных Украинской и Белорусской Церквей.
Принципиальные изменения произошли и в составе паствы РПЦЗ Активную часть ее составили теперь перемещенные лица: военнопленные, жители оккупированных территорий, угнанные на работы в Германию и теперь из опасения вполне вероятных репрессий не пожелавшие вернуться на родину Среди них было и много власовцев, сумевших избежать выдачи советским властям В связи с этим изменилось и географическое распределение приходов Зарубежной Церкви. Если в годы между двумя мировыми войнами центрами сосредоточения их были Балканы и Китай, то теперь на первое место выходит Германия, где в послевоенные годы 22 священника РПЦЗ служили для 200 тысяч перемещенных лиц Значительно усилилось влияние зарубежного Синода и на американском континенте – не только в Северной Америке, но и в странах Южной Америки, где поселилось значительное число «невозвращенцев».
В обстановке начавшейся в 1946 г холодной войны непримиримое отношение зарубежного Синода к РПЦ МП, лояльной советскому правительству, получило поддержку со стороны правительств западных капиталистических держав, в том числе и США Это явилось одной из причин переезда Синода в 1950 г из Мюнхена в Нью-Йорк.