В связи с приближением Советской армии к Белграду владыка Анастасий и его управление должны были срочно эвакуироваться в Германию Митрополит много потрудился для организации православных общин русских беженцев, защищал свободу последних от насильственной репатриации Прибыв в Швейцарию в 1945 г., митрополит Анастасий наладил связь со своими епископами и издал послание, обличающее советскую политику по отношению к Церкви, сохранив этим свободу Русского Православия за рубежом В ноябре 1950 г владыка переехал в Америку.
После войны началось восстановление церковной жизни разбросанной по всему миру Зарубежной Церкви Особое внимание владыка уделял подготовке образованного духовенства По его благословению в 1948 г при Свято-Троицком монастыре в Джорданвилле была открыта духовная семинария.
14 мая 1964 г. в день Преполовения Пятидесятицы митрополит Анастасий ушел на покой, получив, по решению членов Архиерейского Собора РПЦЗ, титул «Блаженнейший» и сохранив за собой почетное председательство в Синоде Первоиерархом РПЦЗ был избран митрополит Филарет (Вознесенский).
Владыка Анастасий почил о Господе 22 мая 1965 г, в день празднования св. Николая Чудотворца, и похоронен в крипте под алтарем Свято-Троицкого собора в Джорданвилле.
Из Завещания Блаженнейшего митрополита Анастасия:
«…Дорогим моим сопастырям и сослужителям во Христе завещаю непоколебимо стоять на камне Святого и спасительного Православия, свято хранить апостольское предание, блюсти братское единение, мир и любовь между собою и оказывать тому, кому Бог укажет после меня вести корабль Зарубежной Церкви, такое доверие и такое же послушание взаимной любви, какое они оказывали моему смирению.
Краеугольным камнем для их взаимных отношений да послужит 34-е апостольское правило, где так глубоко и ясно выражен дух соборного управления в Церкви.
Что касается Московской Патриархии и ее иерархов, то поскольку они находятся в тесном, деятельном и доброжелательном союзе с советской властью, открыто исповедующей свое полное безбожие и стремящейся насадить атеизм во всем русском народе, то с ними Зарубежная Церковь, храня свою чистоту, не должна иметь никакого канонического, молитвенного и даже простого бытового общения, представляя в то же время каждого из них суду Собора будущей свободной Русской Церкви».
Второй Всезарубежный Церковный Собор
Второй Всезарубежный Собор состоялся 14–24 августа 1938 г в Сремских Карловцах при участии 13 архиереев, 26 священнослужителей и 58 мирян, представлявших различные епархии в Европе, Азии и Северной Америке.