В соответствии с приказом «Хартмут» предусмотренные для патрулирования берегов Норвегии тридцать немецких подводных лодок с 8 апреля оставались на своих промежуточных позициях. После того как в течение 9 апреля оперативные сводки придали уверенность в том, что надводные вооруженные силы достигли портов назначения, лодки заняли позиции перед фьордами для предотвращения проникновения враждебных вооруженных сил. Вечером первого дня перед Нарвиком были лодки 1-й группы: U-25, U-46, U-51, U-64, U-65. Перед Тронхеймом (2-я группа) — лодки U-30 и U-34. Перед Бергеном стояла 3-я группа подводных лодок: U-9, U-14, U-56, U-60, U-62; из числа этих лодок впоследствии U-56 передислоцировалась северо-западнее Бергена, так как порт казался достаточно защищенным благодаря присутствию «Кенигсберга». Перед Ставангером патрулировали обе лодки 4-й группы U-1 и U-4. 5-я группа подводных лодок (U-38, U-47, U-48, U-49, U-50, U-52) получила приказ поразить врага, наносящего удары с одной из английских баз на северо-востоке. Между тем в «день Везер» она оставалась на своей позиции северо-восточнее Шетландских островов. Эта позиция оказалась невыгодной, так как английские тяжелые вооруженные силы уже утром 9 апреля находились севернее и восточнее этой линии. Поэтому командование передислоцировало 5-ю группу примерно на 90 морских миль к юго-западу в узкий проход Шетландские острова — Берген. В этот же морской район командование группой «Запад» подтянуло еще и 6-ю группу лодок (U-13, U-57, U-58, U-59), стоящую восточнее и западнее пролива Пентленд-Ферт и в дальнейшем еще по одной лодке 8-й и 9-й групп из районов западнее Линдеснеса и восточнее Шетландских островов. Из этих 12 лодок лишь одна обнаружила вечером 9 апреля группу линкоров, шедших северным курсом, и ночью два тяжелых крейсера, шедшие на юг. Во второй половине дня 9 апреля подводные лодки не обнаружили соединение английских кораблей, и оно было атаковано немецкой военной авиацией в 60 морских милях западнее Бергена.
Чтобы после отвода надводных вооруженных сил усилить далеко выдвинутые базы Нарвик и Тронхейм, туда были передислоцированы субмарины 5-й группы подводных лодок; в дальнейшем им было передано оборудование U-26, U-29, U-43, стоявших в портах приписки для транспортных целей. Теперь все зависело от того, удастся ли защитить занятые в Норвегии позиции.
Морские операции у Дании и Норвегии были поддержаны предусмотренными для этого соединениями руководителя вооруженных сил морской авиации «Запад» и X авиационным корпусом. Авиаразведку Северного моря и пролива Скагеррак принял на себя руководитель вооруженных сил морской авиации «Запад», а охоту за подводными лодками в проливе Каттегат — руководитель вооруженных сил морской авиации «Восток». Военной авиации было приказано воздерживаться от нападений на подводные лодки со дня икс — 4 (5 апреля) в районе Каттегат — Скагеррак — северная часть Северного моря до отмены этого приказа. Со дня икс (9 апреля) из-за возможного изменения сигналов узнавания и, вероятно, необходимой маскировки не должны были производиться нападения на отдельно движущиеся пароходы восточнее 2° и севернее 55°, чтобы не создавать угрозу транспортным кораблям. 8 апреля в 18 часов 24 боевых самолета X авиационного корпуса совершили налет на Скапа и атаковали два линкора и один крейсер, понеся две потери. С самого начала военно-морское руководство не надеялось на ослабление британской боевой мощи в море без боевого воздействия. X авиационный корпус совершил это нападение незначительными силами, так как мероприятия, запланированные на 9 апреля, должны были полностью востребовать все соединения. С рассветом первые эшелоны передислоцировались на подготовленные аэродромы Северной Германии: I группа 76-й эскадры тяжелых бомбардировщиков в Ольборг и II группа 77-й истребительной авиационной эскадры — в Эсбьерг. Другие боевые эскадры были предоставлены для использования против вражеских военно-морских сил, для обороны от вражеского десанта, для поддержки своих высадившихся войск и для показательных полетов над Осло и Копенгагеном. Разведывательные эшелоны и группы пикирующих бомбардировщиков стояли в готовности, чтобы в случае необходимости поддержать высадки в Дании или быть использованными против вражеских военно-морских сил в Скагерраке.